Ensembl MCP Server
E

Ensembl MCP Server

非公式のEnsembl MCPサーバーで、標準化されたインターフェイスを通じてEnsemblゲノムデータベースにアクセスでき、遺伝子検索、配列取得、変異分析などの機能をサポートしています。
2ポイント
5.4K

インストール

以下のコマンドをクライアントにコピーして設定
注意:あなたのキーは機密情報です。誰とも共有しないでください。
lookup_gene
安定したIDまたはシンボルを通じて詳細な遺伝子情報を取得します。
パラメータ
gene_id : string*
説明
Ensembl遺伝子IDまたは遺伝子シンボル(例:ENSG00000139618, BRCA2)
パラメータ
species : string*
説明
種名(デフォルト:homo_sapiens)
パラメータ
expand : boolean*
説明
転写産物とエクソンの詳細を含めます(デフォルト:false)
パラメータ
format : string*
説明
出力形式(デフォルト:json)
get_transcripts
遺伝子のすべての転写産物とその詳細な構造を取得します。
パラメータ
gene_id : string*
説明
Ensembl遺伝子ID
パラメータ
species : string*
説明
種名(デフォルト:homo_sapiens)
パラメータ
canonical_only : boolean*
説明
標準的な転写産物のみを返します(デフォルト:false)
search_genes
名前、説明または識別子を通じて遺伝子を検索します。
パラメータ
query : string*
説明
検索語(遺伝子名、説明または部分一致)
パラメータ
species : string*
説明
種名(デフォルト:homo_sapiens)
パラメータ
feature : string*
説明
検索する特徴のタイプ(デフォルト:gene)
パラメータ
biotype : string*
説明
生物タイプでフィルタリングします(例:protein_coding, lncRNA)
パラメータ
limit : number*
説明
最大結果数(1 - 200、デフォルト:25)
get_sequence
ゲノム座標または遺伝子/転写産物IDのDNA配列を取得します。
パラメータ
region : string*
説明
ゲノム領域(chr:start - end)または特徴ID
パラメータ
species : string*
説明
種名(デフォルト:homo_sapiens)
パラメータ
format : string*
説明
出力形式(デフォルト:fasta)
パラメータ
mask : string*
説明
繰り返し配列のマスクタイプ(オプション)
パラメータ
multiple_sequences : boolean*
説明
該当する場合、複数の配列を返します(デフォルト:false)
get_cds_sequence
転写産物のコード配列(CDS)を取得します。
パラメータ
transcript_id : string*
説明
Ensembl転写産物ID
パラメータ
species : string*
説明
種名(デフォルト:homo_sapiens)
パラメータ
format : string*
説明
出力形式(デフォルト:fasta)
translate_sequence
DNA配列をタンパク質配列に翻訳します。
パラメータ
sequence : string*
説明
翻訳するDNA配列
パラメータ
genetic_code : number*
説明
遺伝暗号表(デフォルト:1は標準)
get_homologs
異なる種間の直列相同遺伝子と並列相同遺伝子を検索します。
パラメータ
gene_id : string*
説明
Ensembl遺伝子ID
パラメータ
species : string*
説明
元の種名(デフォルト:homo_sapiens)
パラメータ
target_species : string*
説明
対象種(オプション)
パラメータ
type : string*
説明
相同タイプ(デフォルト:all)
パラメータ
format : string*
説明
出力形式(デフォルト:json)
get_gene_tree
遺伝子ファミリーの系統樹を取得します。
パラメータ
gene_id : string*
説明
Ensembl遺伝子ID
パラメータ
species : string*
説明
種名(デフォルト:homo_sapiens)
パラメータ
format : string*
説明
樹形図の形式(デフォルト:json)
パラメータ
clusterset_id : string*
説明
特定のクラスタセットID(オプション)
get_variants
ゲノム領域の遺伝的変異を取得します。
パラメータ
region : string*
説明
ゲノム領域(chr:start - end)
パラメータ
species : string*
説明
種名(デフォルト:homo_sapiens)
パラメータ
format : string*
説明
出力形式(デフォルト:json)
パラメータ
consequence_type : array*
説明
結果のタイプでフィルタリングします。
get_variant_consequences
変異が遺伝子と転写産物に与える影響を予測します。
パラメータ
variants : array*
説明
変異IDまたはHGVS表記
パラメータ
species : string*
説明
種名(デフォルト:homo_sapiens)
get_regulatory_features
ゲノム領域の調節エレメント(エンハンサー、プロモーター、TFBS)を取得します。
パラメータ
region : string*
説明
ゲノム領域(chr:start - end)
パラメータ
species : string*
説明
種名(デフォルト:homo_sapiens)
パラメータ
feature_type : string*
説明
調節特徴のタイプ(オプション)
パラメータ
cell_type : string*
説明
細胞タイプのコンテキスト(オプション)
get_motif_features
ゲノム領域の転写因子結合モチーフを取得します。
パラメータ
region : string*
説明
ゲノム領域(chr:start - end)
パラメータ
species : string*
説明
種名(デフォルト:homo_sapiens)
パラメータ
binding_matrix : string*
説明
特定の結合マトリックス(オプション)
get_xrefs
遺伝子の外部データベースの相互参照を取得します。
パラメータ
gene_id : string*
説明
Ensembl遺伝子ID
パラメータ
species : string*
説明
種名(デフォルト:homo_sapiens)
パラメータ
external_db : string*
説明
特定の外部データベース(オプション)
パラメータ
all_levels : boolean*
説明
転写産物と翻訳の相互参照を含めます(デフォルト:false)
map_coordinates
ゲノムアセンブリ間で座標を変換します。
パラメータ
region : string*
説明
ゲノム領域(chr:start - end)
パラメータ
species : string*
説明
種名(デフォルト:homo_sapiens)
パラメータ
target_assembly : string*
説明
対象のアセンブリ名
list_species
利用可能な種とアセンブリのリストを取得します。
パラメータ
division : string*
説明
Ensembl分類(例:vertebrates, plants, fungi)
get_assembly_info
ゲノムアセンブリの情報と統計を取得します。
パラメータ
species : string*
説明
種名(デフォルト:homo_sapiens)
パラメータ
bands : boolean*
説明
染色体のバンドパターンを含めます(デフォルト:false)
get_karyotype
染色体情報と核型を取得します。
パラメータ
species : string*
説明
種名(デフォルト:homo_sapiens)
batch_gene_lookup
複数の遺伝子を同時に検索します。
パラメータ
gene_ids : array*
説明
遺伝子IDのリスト(最大200個)
パラメータ
species : string*
説明
種名(デフォルト:homo_sapiens)
パラメータ
format : string*
説明
出力形式(デフォルト:json)
batch_sequence_fetch
複数の領域または特徴の配列を取得します。
パラメータ
regions : array*
説明
領域または特徴IDのリスト(最大50個)
パラメータ
species : string*
説明
種名(デフォルト:homo_sapiens)
パラメータ
format : string*
説明
出力形式(デフォルト:fasta)

代替品

Z
Zen MCP Server
Zen MCPは多モデルAI協調開発サーバーで、ClaudeやGemini CLIなどのAIコーディングアシスタントに強化されたワークフローツールとモデル間のコンテキスト管理を提供します。これは複数のAIモデルのシームレスな協調をサポートし、コードレビュー、デバッグ、リファクタリングなどの開発タスクを実現し、異なるワークフロー間で会話のコンテキストを維持することができます。
Python
9.5K
5ポイント
O
Opendia
OpenDiaはオープンソースのブラウザ拡張ツールで、AIモデルが直接ユーザーのブラウザを制御でき、既存のログイン状態、ブックマークなどのデータを利用して自動化操作を行います。複数のブラウザとAIモデルをサポートし、プライバシー保護に配慮しています。
JavaScript
8.4K
5ポイント
N
Notte Browser
認証済み
NotteはオープンソースのフルスタックネットワークAIエージェントフレームワークで、ブラウザセッション、自動化されたLLM駆動エージェント、ウェブページの監視と操作、資格情報管理などの機能を提供し、インターネットをエージェントに優しい環境に変え、自然言語でウェブサイトの構造を記述することでLLMの認知負荷を軽減することを目的としています。
12.9K
4.5ポイント
M
MCP Server Airbnb
認証済み
Airbnbの宿泊施設検索と詳細照会のMCPサービス
TypeScript
10.0K
4ポイント
B
Bing Search MCP
Microsoft Bing検索APIを統合するためのMCPサーバーで、ウェブページ、ニュース、画像の検索機能をサポートし、AIアシスタントにウェブ検索機能を提供します。
Python
12.5K
4ポイント
C
Cloudflare
Changesetsは、マルチパッケージまたはシングルパッケージのリポジトリのバージョン管理とリリースを管理するためのビルドツールです。
TypeScript
8.9K
5ポイント
E
Eino
Einoは、Golang用に設計されたLLMアプリケーション開発フレームワークで、シンプルで拡張可能で信頼性が高く効率的なコンポーネント抽象化と編成機能により、AIアプリケーションの開発プロセスを簡素化することを目的としています。豊富なコンポーネントライブラリ、強力なグラフ編成機能、完全なストリーム処理サポート、および高度に拡張可能なアスペクトメカニズムを提供し、開発からデプロイまでの全サイクルのツールチェーンを網羅しています。
Go
13.2K
5ポイント
M
Modelcontextprotocol
認証済み
このプロジェクトは、Sonar APIを統合したMCPサーバーの実装で、Claudeにリアルタイムのネットワーク検索機能を提供します。システムアーキテクチャ、ツールの設定、Dockerデプロイ、およびマルチプラットフォーム統合ガイドが含まれています。
TypeScript
10.5K
5ポイント
E
Edgeone Pages MCP Server
EdgeOne Pages MCPは、MCPプロトコルを通じてHTMLコンテンツをEdgeOne Pagesに迅速にデプロイし、公開URLを取得するサービスです。
TypeScript
12.6K
4.8ポイント
G
Gmail MCP Server
Claude Desktop用に設計されたGmail自動認証MCPサーバーで、自然言語でのやり取りによるGmailの管理をサポートし、メール送信、ラベル管理、一括操作などの完全な機能を備えています。
TypeScript
10.0K
4.5ポイント
C
Context7
Context7 MCPは、AIプログラミングアシスタントにリアルタイムのバージョン固有のドキュメントとコード例を提供するサービスで、Model Context Protocolを通じてプロンプトに直接統合され、LLMが古い情報を使用する問題を解決します。
TypeScript
22.1K
4.7ポイント
B
Baidu Map
認証済み
百度マップMCPサーバーは国内初のMCPプロトコルに対応した地図サービスで、地理コーディング、ルート計画など10個の標準化されたAPIインターフェースを提供し、PythonとTypescriptでの迅速な接続をサポートし、エージェントに地図関連の機能を実現させます。
Python
19.2K
4.5ポイント
G
Gitlab MCP Server
認証済み
GitLab MCPサーバーは、Model Context Protocolに基づくプロジェクトで、GitLabアカウントとのやり取りに必要な包括的なツールセットを提供します。コードレビュー、マージリクエスト管理、CI/CD設定などの機能が含まれます。
TypeScript
9.0K
4.3ポイント
U
Unity
認証済み
UnityMCPはUnityエディターのプラグインで、モデルコンテキストプロトコル (MCP) を実装し、UnityとAIアシスタントのシームレスな統合を提供します。リアルタイムの状態監視、リモートコマンドの実行、ログ機能が含まれます。
C#
11.9K
5ポイント
M
Magic MCP
Magic Component Platform (MCP) はAI駆動のUIコンポーネント生成ツールで、自然言語での記述を通じて、開発者が迅速に現代的なUIコンポーネントを作成するのを支援し、複数のIDEとの統合をサポートします。
JavaScript
13.7K
5ポイント
S
Sequential Thinking MCP Server
MCPプロトコルに基づく構造化思考サーバーで、思考段階を定義することで複雑な問題を分解し要約を生成するのに役立ちます。
Python
12.3K
4.5ポイント
AIbase
智啓未来、あなたの人工知能ソリューションシンクタンク
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