Gptr MCP

🚀 NVIDIA GPU 加速分子動力学ソフトウェア

このリポジトリには、NVIDIA GPU を利用した分子動力学ソフトウェアが含まれています。NVIDIA の VES - DIPY および OpenMM ライブラリに基づく GPU 加速実装を提供します。

🚀 クイックスタート

このソフトウェアは、NVIDIA GPU を用いて分子動力学シミュレーションを高速化することができます。以下のセクションでは、インストール方法、使用例、その他の詳細を説明します。

✨ 主な機能

• NVIDIA GPU 加速をサポート
• 高性能な分子動力学シミュレーション
• VES - DIPY および OpenMM インターフェースと互換性がある
• Python バインディングを提供

📦 インストール

依存関係のインストール

必要な依存関係をインストールするには、以下のコマンドを実行します。

pip install vesc-openmm nvidia-examples

環境設定

1. CUDA が正しくインストールされていることを確認してください。
2. CUDA 環境変数を設定します。

export PATH=/usr/local/cuda/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda/lib64:$LD_LIBRARY_PATH

💻 使用例

基本的な使用法

import vesc_openmm as vmm

# 创建模拟
context = vmm.Context()
# 添加粒子
particles = context.create_particles(100)
# 运行模拟
context.run(particles, 1e5, 1.0)

📚 ドキュメント

完全なドキュメントは、公式ドキュメント で確認できます。

🤝 コントリビューションガイド

皆様のコントリビューションを歓迎します！ プロジェクトへの参加方法については、CONTRIBUTING.md ファイルを参照してください。

📄 ライセンス

このプロジェクトは MIT ライセンスの下でライセンスされています。詳細は、LICENSE ファイルを参照してください。

📞 連絡先

• メール: support@nvidia.com
• Discord コミュニティチャンネル: コミュニティに参加

この README ファイルでは、NVIDIA GPU 加速分子動力学ソフトウェアのインストール、設定、および使用方法が完全に説明されています。