Molecule Visualization (ChimeraX, PyMOL)

🚀 Molecule-MCP

Molecule-MCPは、分子科学関連ツールとClaude AIの間のモデルコンテキストプロトコル（Model Context Protocol, MCP）サーバーです。Molecule-MCPは分子科学研究ツールをClaude AIに接続し、Claudeがこれらのツールを直接操作し、科学者のパートナーとして機能できるようにします。この統合により、プロンプト支援型の分子モデリングが実現されます。

🚀 クイックスタート

Molecule-MCPは、分子科学研究ツールとClaude AIを接続し、Claudeがこれらのツールを直接操作できるようにします。以下に、その使い方を説明します。

✨ 主な機能

• 分子科学研究ツールとClaude AIの接続を可能にする。
• Claudeが分子科学研究ツールを直接操作できるようにする。
• プロンプト支援型の分子モデリングを実現する。

📦 インストール

⚠️ 重要提示

Molecule-MCPを使用するには、Claude Desktopがインストールされ、実行されている必要があります。

1. Claudeを開き、「設定」>「開発者」>「編集設定」>「claude_desktop_config.json」を選択し、以下の内容を追加します。

{
  "mcpServers": {
    "pymol": {
      "command": "/path/to/mcp",
      "args": [
        "run",
        "/path/to/molecule-mcp/pymol_server.py"
      ]
    },
    "chimerax": {
      "command": "/path/to/mcp",
      "args": [
        "run",
        "/path/to/molecule-mcp/ChimeraX_server.py"
      ]
    },
    "gromacs_copilot": {
      "command": "/path/to/mcp",
      "args": [
        "run",
        "/path/to/molecule-mcp/mcp_server.py"
      ]
    }
  }
}

2. mcpをインストールし、スクリプトを取得します。

pip install "mcp[cli]" chatmol
pip install git+https://github.com/ChatMol/gromacs_copilot.git # オプション、gromacs_copilotを実行する場合
which mcp

mcpのパスが表示されます。このパスをコピーし、/path/to/mcpを置き換えます。

git clone https://github.com/ChatMol/molecule-mcp.git
cd molecule-mcp
pwd

分子-MCPのパスが表示されます。このパスをコピーし、/path/to/molecule-mcpを置き換えます。

📄 免責事項

Molecule-MCPは「現状のまま」提供され、明示または黙示を問わず、いかなる形式の保証もされません。作者および貢献者は、商品性および特定の目的への適合性を含むすべての保証を放棄します。ユーザーは、このソフトウェアを使用する際のすべてのリスクを自ら負います。

作者は、このソフトウェアまたはその出力の使用、誤用、または誤解に起因するいかなる結果についても責任を負いません。Molecule-MCPを通じて得られた結果は、研究、出版物、または意思決定の過程で独立して検証する必要があります。

このソフトウェアは、研究および教育目的のみに使用されることを意図しています。ユーザーは、自らの管轄区域内の適用される法律、規制、および倫理基準を遵守することを完全に責任を負います。