AACT Clinical Trials

🚀 AACT 臨床試験 MCP サーバー

このサーバーは、FastMCP フレームワークを使用して実装されたモデルコンテキストプロトコル (Model Context Protocol) サーバーで、AACT（ClinicalTrials.gov の総合分析）データベースへのアクセスを提供します。AI アシスタントが ClinicalTrials.gov データベースから直接臨床試験データを照会できるようになります。

✨ 主な機能

ツール

• list_tables

  • AACT データベース内のすべての利用可能なテーブルの概要を取得します。
  • 分析を行う前にデータベース構造を把握するために使用します。

• describe_table

  • 特定の AACT テーブルの詳細な構造を表示します。
  • 列名とデータ型を表示します。
  • 例: {"table_name": "studies"}

• read_query

  • AACT 臨床試験データベース上で SELECT クエリを実行します。
  • SQL クエリを安全に処理し、検証します。
  • 例: {"query": "SELECT nct_id, brief_title FROM ctgov.studies LIMIT 5"}

• append_insight

  • 分析過程で見つかった重要な洞察を記録します。
  • 分析の叙述を構築するのに役立ちます。
  • 例: {"finding": "過去五年間で、3 期の腫瘍学試験の数が 15% 増加しました"}

リソース

• schema://database

  • データベーススキーマの JSON リソースを返します。

• memo://insights

  • セッション中に収集された洞察のメモを返します。

📦 インストール

必要な環境変数

• DB_USER：あなたの AACT データベースのユーザー名
• DB_PASSWORD：あなたの AACT データベースのパスワード

💻 使用例

基本的な使用法

from semantic_kernel import Kernel
from semantic_kernel.connectors.mcp import MCPStdioPlugin

# AACT 臨床試験 MCP プラグインを作成
aact_mcp = MCPStdioPlugin(
    name="aact",
    description="臨床試験データベースプラグイン",
    command="uvx",
    args=["mcp-server-aact"],
    env={
        "DB_USER": "your_aact_username", 
        "DB_PASSWORD": "your_aact_password"
    }
)

# Semantic Kernel に追加
kernel = Kernel()
kernel.add_plugin(aact_mcp)

例題

以下は、このプラグインと一緒に使用する例題です。

1. 「乳がんの臨床試験で最も一般的な介入措置のタイプは何ですか？」
2. 「2023 年に完了した 3 期の臨床試験はいくつありましたか？」
3. 「各国の糖尿病試験の参加者統計を表示してください」
4. 「過去五年間で、何パーセントの腫瘍学試験が結果を報告しましたか？」

🔧 技術詳細

このサーバーは以下の技術を使用して構築されています。

• FastMCP：モデルコンテキストプロトコルの実装に使用
• Python psycopg2：PostgreSQL データベースへの接続に使用
• AACT データベース：ClinicalTrials.gov の情報のデータソースとして使用

📄 ライセンス

MIT ライセンス

貢献

貢献を歓迎します！以下の手順で行ってください。

• GitHub でイシューを作成する
• 議論を開始する
• メール: jonas.walheim@navis-bio.com

謝辞

このプロジェクトは以下のプロジェクトに触発され、当初はそれらのコードをベースにしています。

• SQLite MCP サーバー
• DuckDB MCP サーバー
• OpenDataMCP

これらの素晴らしいプロジェクトに感謝します！ 🙌