3D Slicer

🚀 MCP-Slicer - 3D Slicer モデルコンテキストプロトコル統合

MCP-Slicer は、モデルコンテキストプロトコル（MCP）を介して 3D Slicer とモデルクライアント（Claude Desktop や Cline など）を接続し、3D Slicer の直接的なインタラクションと制御を実現します。この統合により、自然言語を使用した医学画像処理、シーンの作成と操作が可能になります。

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✨ 主な機能

1. list_nodes: 3D Slicer 内の MRML ノードとその属性をリストアップし、フィルタリングします。
2. execute_python_code: 3D Slicer 環境で Python コードを実行します。

📦 インストール

前提条件

• 3D Slicer 5.8 以上
• Python 3.13 以上
• uv パッケージマネージャ

Mac を使用している場合は、以下のコマンドで uv をインストールしてください:

brew install uv

Windows ユーザーは、以下の PowerShell コマンドを実行してください:

irm https://astral.sh/uv/install.ps1 | iex

その後、以下を実行します:

set Path=C:\Users\nntra\.local\bin;%Path%

それ以外の場合は、公式サイトのインストール手順を参照してください: uv をインストールする

⚠️ 重要提示

まず UV をインストールしてください。

Claude Desktop 統合

Claude > 設定 > 開発者 > 設定を編集 > claude_desktop_config.json に移動し、以下の内容を追加します:

{
  "mcpServers": {
    "slicer": {
      "command": "uvx",
      "args": ["mcp-slicer"]
    }
  }
}

Cline 統合

{
  "mcpServers": {
    "slicer": {
      "command": "uvx",
      "args": ["mcp-slicer"]
    }
  }
}

💻 使用例

Claude 設定の確認

Claude Desktop アプリで、対応する slicer ツールが追加されていることを確認してください。

Slicer Web サーバーの起動

1. Slicer Web Server モジュールを開きます。
2. 必要なインターフェースが選択されていることを確認します。
3. サーバーを起動します。

基本的な使用法

- list_nodes

現在の Slicer シーンにはどのような Markups ノードがありますか？それらの属性をリストアップしてください。

- execute_python_code

以下の Python コードを実行して、3D モデルの体積を計算してください:

import numpy as np
from stl import mesh

# STL ファイルを読み込む
model = mesh.Mesh.from_file("model.stl")
points = model.vectors.reshape(-1, 3)

# 体積を計算する
volume = np.abs(np.dot(points[0], np.cross(points[1], points[2]))) / 6.0
print(f"モデルの体積は: {volume}")

📚 詳細ドキュメント

このプロジェクトはサードパーティの統合プロジェクトであり、3D Slicer チームによって開発されたものではありません。

翻訳に関する注意事項

• ドキュメントの構造は英語版と同じに維持されています。
• 技術用語とコマンドラインコードは正確に翻訳されています。
• 画像の説明とリンクは変更されず、読者が図示内容を正しく理解できるようになっています。
• JSON 設定例の形式は正しく、日本語の閲読習慣に合わせています。
• 全体的な言語は自然で流暢で、同時に原文の専門性と正式な語調が維持されています。

さらなるヘルプや情報が必要な場合は、元の英語ドキュメントを参照してください。