Osdr MCP Server

🚀 🧠 OSDR MCP サーバーとプロキシ

このリポジトリは、NASAのオープンサイエンスデータリポジトリ（OSDR）とやり取りするために、MCPプロキシをカスタムツールに統合する方法を示しています。Model Context Protocol (MCP) ワークフローを使用して生物データを分析および要約するサンプルプロキシも含まれています。

📦 含まれる内容

osdr_mcp/

OSDRデータとのやり取りを可能にするカスタムMCPサーバーです。以下のようなツールを提供します。

• osdr_fetch_metadata：指定されたOSDRデータセットのメタデータを取得します。
• osdr_find_by_organism：生物種に基づいて研究をフィルタリングします。
• 他のツール（例：RNA分析）は osdr_viz_tools にあります。

first_example/

2つの公式MCPサーバーを使用するシンプルなプロキシです。

• mcp-server-fetch（ヘッドレスブラウザ）
• mcp-server-filesystem

このプロキシは情報を収集し、ツイートサイズの要約を生成します。

second_example/

first_example と似ていますが、osdr_mcp/main_simple.py で定義されたカスタムMCPサーバーに接続します。OSDRメタデータ検索ツールなどの特定分野のツールを統合する方法を示しています。

third_example/

完全なマルチプロキシワークフローです。

1. 取得プロキシ - OSD研究のメタデータを収集します。
2. 定量分析プロキシ - RNAカウントデータをダウンロードし、棒グラフを作成します。
3. 要約作成プロキシ - 分析の要約を含むMarkdownレポートを生成します。

以下のカスタムMCPサーバーを使用します。

• osdr_data_fetch
• osdr_viz_tools

⚙️ 設定

cp_agent.config.yaml ファイルで以下を制御します。

• LLMバックエンド（例：Ollama、OpenAI）
• MCPサーバーへの接続
• ツールの可用性
• システムプロンプト / メタデータ

🚀 クイックスタート

1. このリポジトリをクローンします。
2. 依存関係をインストールします。

   pip install -r requirements.txt
   

3. サンプルを実行します。

   python first_example/main.py
   

または、直接MCPサーバーを起動します。

python osdr_mcp/main_simple.py

🧩 統合の説明

このアーキテクチャは柔軟性を提供するように設計されています。ドキュメントの質問応答、RAG検索、またはカスタム分析ツールを必要に応じて切り替えることができます。ユーザーインターフェイスの統合には、モード切り替えまたはUI切り替えを使用するのが理想的です。MilvusベースのRAGサポートは開発中です。

📚 リソース

• Model Context Protocol
• NASA OSDR API