Osdr MCP Server

🚀 🧠 OSDR MCP 服務器與代理

本項目展示瞭如何將 MCP 代理集成到自定義工具中，從而實現與 NASA 的開放科學數據存儲庫（OSDR）的交互。項目還包含使用 Model Context Protocol (MCP) 工作流對生物數據進行分析和總結的示例代理，為相關領域的數據處理提供了實用的解決方案。

📦 包含內容

osdr_mcp/

這是一個自定義的 MCP 服務器，提供了與 OSDR 數據交互的實用工具：

• osdr_fetch_metadata：可獲取給定 OSDR 數據集的元數據。
• osdr_find_by_organism：能按生物體對研究進行過濾。
• 其他工具（例如 RNA 分析）存於 osdr_viz_tools 中。

first_example/

這是一個簡單的代理，使用了兩個官方 MCP 服務器：

• mcp-server-fetch（無頭瀏覽器）
• mcp-server-filesystem

該代理會收集信息並生成一條推文大小的摘要。

second_example/

此示例與 first_example 類似，但連接到 osdr_mcp/main_simple.py 定義的自定義 MCP 服務器。它演示瞭如何集成特定領域的工具，例如 OSDR 元數據檢索器。

third_example/

這是一個完整的多代理工作流：

1. 獲取代理：抓取 OSD 研究元數據。
2. 定量分析代理：下載 RNA 計數數據並創建條形圖。
3. 摘要編寫器代理：生成包含分析總結的 Markdown 報告。

此工作流使用了自定義 MCP 服務器：

• osdr_data_fetch
• osdr_viz_tools

⚙️ 配置

cp_agent.config.yaml 文件可控制以下內容：

• LLM 後端（例如 Ollama、OpenAI）
• MCP 服務器連接
• 工具可用性
• 系統提示 / 元數據

🚀 快速開始

克隆倉庫並安裝依賴

1. 克隆此倉庫。
2. 安裝依賴項：

   pip install -r requirements.txt
   

運行示例或啟動服務器

運行示例

python first_example/main.py

直接啟動 MCP 服務器

python osdr_mcp/main_simple.py

🧩 集成說明

本架構具有高度的靈活性，您可以根據實際需求在文檔問答、RAG 搜索或自定義分析工具之間進行切換。對於用戶界面集成，建議使用模式開關或 UI 切換。基於 Milvus 的 RAG 支持正在開發中。

📚 資源

• Model Context Protocol
• NASA OSDR API