Chembl MCP Server

🚀 ChEMBL-MCP-Server

ChEMBL-MCP-Server 是一個基於 chembl_webresource_client 包的快速 MCP 包裝服務器，它為用戶提供了便捷訪問 ChEMBL 數據庫的 API 途徑，能有效滿足各類數據查詢和處理需求。

🚀 快速開始

本服務器提供了多種啟動方式，以滿足不同場景的使用需求。以下是啟動服務器的詳細步驟及可用參數說明：

啟動服務器

# 使用默認配置啟動HTTP服務器
python chembl_searver.py

# 指定主機和端口
python chembl_searver.py --host 0.0.0.0 --port 8080

# 使用stdio傳輸
python chembl_searver.py --transport stdio

# 設置日誌級別
python chembl_searver.py --log-level DEBUG

可用參數

✨ 主要特性

• 完整的 API 訪問：支持對 ChEMBL 數據庫的完整 API 訪問，方便用戶獲取各類數據。
• 異步 API 調用：藉助 FastMCP 框架實現異步 API 調用，提升數據處理效率。
• 錯誤處理與超時機制：內置錯誤處理和超時機制，保障服務器的穩定運行。
• 多傳輸方法支持：支持 HTTP 和 stdio 傳輸方法，滿足不同場景的使用需求。
• 完善的註解與文檔：提供完整的類型註解和文檔字符串，便於開發者理解和使用。

📦 安裝指南

# 克隆倉庫
git clone https://github.com/yourusername/ChEMBL-MCP-Server.git
cd ChEMBL-MCP-Server

# 安裝依賴
pip install -r requirements.txt

💻 使用示例

查看 chembl_search.py 文件以獲取使用各種 API 的示例。

基礎用法

# 參考 chembl_search.py 文件中的代碼示例

📚 詳細文檔

API 功能

該服務器提供以下 API 功能：

數據實體 API

• example_activity：獲取活性數據
• example_assay：獲取測定數據
• example_target：獲取靶點數據
• example_molecule：獲取分子數據
• example_drug：獲取藥物數據
• 更多數據實體 API...

化學工具 API

• example_canonicalizeSmiles：規範 SMILES 字符串
• example_smiles2inchi：將 SMILES 轉換為 InChI
• example_smiles2svg：將 SMILES 轉換為 SVG 圖像
• example_structuralAlerts：獲取結構警戒信息
• 更多化學工具 API...

🔧 技術細節

依賴項

📄 許可證

本項目採用 MIT 許可證。