Pubmed MCP Server

🚀 PubMed 分析 MCP 服務器

這是一個專業的PubMed醫學文獻分析MCP服務器，由苦逼醫學生自主開發，目前功能仍在不斷完善中。它能幫助科研人員快速洞察醫學研究動態，歡迎各位提出建議和改進！

🚀 快速開始

1. 安裝依賴：運行 pip install -r requirements.txt 或使用uv環境安裝。
2. 配置mcp.json文件，添加PubMed服務器配置。
3. 啟動MCP服務器並開始分析任務。

✨ 主要特性

• 文獻檢索：支持PubMed高級檢索語法，可設置日期範圍和結果數量。
• 熱點分析：統計關鍵詞頻率，識別熱門研究方向，彙總相關文獻。
• 趨勢追蹤：追蹤關鍵詞隨時間的頻率變化，揭示研究趨勢演變。
• 發文統計：提供靈活的時間週期設置，分析文獻數量變化。
• 全面報告：一鍵生成包含熱點、趨勢和統計的分析報告。

📦 安裝指南

# 安裝依賴
pip install -r requirements.txt
# 或使用uv
uv pip install -r requirements.txt

💻 使用示例

基礎用法

# 安裝依賴
pip install -r requirements.txt
# 或使用uv
uv pip install -r requirements.txt

高級用法

Write mcp.json

因為我習慣用uv虛擬環境，因此這裡直接使用python的路徑運行python文件。

// Add the following configuration in mcp.json (for Windows)
"PubMed": {
        "command": "cmd",
        "args": [
          "/c",
          "path/to/python.exe",
          "path/to/server.py"
        ]
    }
// For example, my mcp.json file looks like this
{
    "mcpServers": {
      "fetch":{
        "command": "cmd",
        "args": [
          "/c",
          "uvx",
          "mcp-server-fetch"
        ]
      },
      "PubMed": {
        "command": "cmd",
        "args": [
          "/c",
          "path/to/python.exe",
          "path/to/server.py"
        ]
      }
    }
  }

📚 詳細文檔

MCP工具

1. search_pubmed

搜索PubMed並保存結果。 主要參數：

• email：您的電子郵件（必填）
• advanced_search：PubMed搜索查詢（必填，與高級檢索語法相同）
• max_results：最大結果數（默認：1000）

2. list_result_files

列出可用的結果文件。

3. analyze_research_hotspots

分析研究熱點。 主要參數：

• filename：結果文件名（必填）
• top_n：分析的關鍵詞數量（默認：20）

4. analyze_research_trends

分析研究趨勢。

5. analyze_publication_count

分析發文數量。

6. generate_comprehensive_analysis

生成全面分析報告。

⚠️ 注意事項

⚠️ 重要提示

• 本項目是一個新開發的MCP服務器，旨在幫助醫學研究人員分析PubMed文獻。
• 分析結果將保存在指定文件夾中，請確保路徑正確。
• 安裝依賴時請確保網絡暢通，並根據需要選擇Python版本。

感謝您的支持與理解！