Nexonco (CIViC Precision Oncology)

🚀 Nexonco 臨床証拠検索ツール

Nexoncoは、Nexgene 研究によって提供される、MCPプロトコルに基づくサーバーです。CIViC（臨床変異の癌における医学的解釈）データベースから臨床証拠を取得するために使用され、変異、疾患、薬剤、表現型情報の迅速かつ柔軟な検索をサポートし、精密腫瘍学研究を支援します。

🚀 クイックスタート

デモ

https://github.com/user-attachments/assets/02129685-5ba5-4b90-89e7-9d4a39986210

完全な動画を見るには、こちらをクリックしてください。

インストールと設定

依存関係

Python >= 3.6
Jupyter Notebook
requests
pandas

設定手順

1. リポジトリをクローンします：

   git clone https://github.com/Nexgene-Research/nexonco-mcp.git
   cd nexonco-mcp
   

2. 依存関係をインストールします：

   pip install -r requirements.txt
   

3. サーバーを起動します：

   python server.py
   

✨ 主な機能

核心機能

• リアルタイムデータ検索：CIViCデータベースから最新の臨床証拠を取得します。
• 多条件検索：変異、疾患、薬剤、表現型の組み合わせ検索をサポートします。
• 結果の可視化：検索結果を表とグラフで表示し、分析を容易にします。

機能の使用例

# 特定の薬剤の効果を検索する
results = query_therapies("Imatinib", "leukemia")
print(results)

📚 ドキュメント

入力形式

{
  "query": {
    "therapy": "Imatinib",
    "disease": "leukemia"
  },
  "options": {
    "include": ["evidence_level", "clinical_significance"]
  }
}

出力形式

[
  {
    "therapy": "Imatinib",
    "disease": "leukemia",
    "evidence_level": "Level 1",
    "clinical_significance": "Effective"
  },
  ...
]

検索例

• 質問：膵臓癌の証拠と関連する治療法は何ですか？
• 検索コード：

  results = query_therapies(disease="pancreatic cancer")
  print(results)
  

📄 ライセンス

このプロジェクトはMITライセンスの下で公開されています。詳細な条項は、LICENSEファイルを参照してください。

⚠️ 免責事項

このツールは研究目的のみで使用されることを意図しています。専門的な医療アドバイス、診断、または治療の代替として使用することはできません。

貢献者

• Obada Qasem (@obadaqasem)、Nexgene AI
• Kutsal Ozkurt (@Goodsea)、Nexgene AI