Nexonco (CIViC Precision Oncology)

🚀 Nexonco 臨床證據查詢工具

Nexonco 由 Nexgene 研究提供，是一個基於 MCP 協議的服務器。它能從 CIViC（臨床變體在癌症中的醫學解釋）數據庫中訪問臨床證據，支持快速、靈活地搜索變異、疾病、藥物和表型信息，助力精準腫瘤學研究。

🚀 快速開始

演示

https://github.com/user-attachments/assets/02129685-5ba5-4b90-89e7-9d4a39986210

觀看完整視頻：此處

安裝與配置

依賴項

Python >= 3.6
Jupyter Notebook
requests
pandas

配置步驟

1. 克隆倉庫：

   git clone https://github.com/Nexgene-Research/nexonco-mcp.git
   cd nexonco-mcp
   

2. 安裝依賴項：

   pip install -r requirements.txt
   

3. 啟動服務器：

   python server.py
   

✨ 主要特性

核心功能

• 即時數據查詢：通過 CIViC 數據庫獲取最新的臨床證據。
• 多條件搜索：支持對變異、疾病、藥物和表型的組合查詢。
• 結果可視化：以表格和圖表形式展示查詢結果，便於分析。

示例用例

# 查詢特定藥物的療效
results = query_therapies("Imatinib", "leukemia")
print(results)

📚 詳細文檔

使用說明

輸入格式

{
  "query": {
    "therapy": "Imatinib",
    "disease": "leukemia"
  },
  "options": {
    "include": ["evidence_level", "clinical_significance"]
  }
}

輸出格式

[
  {
    "therapy": "Imatinib",
    "disease": "leukemia",
    "evidence_level": "Level 1",
    "clinical_significance": "Effective"
  },
  ...
]

示例查詢

查詢示例

• 問題：哪些療法與胰腺癌證據相關？
• 查詢代碼：

  results = query_therapies(disease="pancreatic cancer")
  print(results)
  

📄 許可證

本項目採用 MIT 許可證，具體條款請參見 LICENSE 文件。

⚠️ 重要提示

本工具僅供研究用途。它不能替代專業醫療建議、診斷或治療。

👥 貢獻者

• Obada Qasem (@obadaqasem)，Nexgene AI
• Kutsal Ozkurt (@Goodsea)，Nexgene AI