Chembl MCP Server

🚀 ChEMBL-MCP-Server

chembl_webresource_client パッケージをベースにした FastMCP ラッピングサーバーで、ChEMBL データベースへの API アクセスを提供します。

🚀 クイックスタート

このサーバーは、chembl_webresource_client パッケージを利用した FastMCP のラッピングサーバーで、ChEMBL データベースへの API アクセスを提供します。以下に、サーバーの起動方法や使用可能な API 機能などを説明します。

✨ 主な機能

• ChEMBL データベースへの包括的な API アクセス
• FastMCP フレームワークを使用した非同期 API 呼び出し
• 組み込みのエラー処理とタイムアウト機構
• HTTP と stdio の伝送方法をサポート
• 完全な型アノテーションとドキュメント文字列

📦 インストール

# リポジトリをクローン
git clone https://github.com/yourusername/ChEMBL-MCP-Server.git
cd ChEMBL-MCP-Server

# 依存関係をインストール
pip install -r requirements.txt

💻 使用例

基本的な使用法

# デフォルト設定で HTTP サーバーを起動
python chembl_searver.py

# ホストとポートを指定
python chembl_searver.py --host 0.0.0.0 --port 8080

# stdio 伝送を使用
python chembl_searver.py --transport stdio

# ログレベルを設定
python chembl_searver.py --log-level DEBUG

高度な使用法

# サーバー起動時に利用可能なパラメータについて説明します。
# --host：サーバーのホストアドレスで、デフォルトは 127.0.0.1 です。
# --port：サーバーのポートで、デフォルトは 8000 です。
# --transport：伝送方法で、http または stdio が選択可能で、デフォルトは http です。
# --log-level：ログレベルで、DEBUG、INFO、WARNING、ERROR、CRITICAL が選択可能で、デフォルトは INFO です。

利用可能なパラメータ

📚 ドキュメント

API 機能

このサーバーは以下の API 機能を提供しています。

データエンティティ APIs

• example_activity：アクティビティデータを取得します。
• example_assay：アッセイデータを取得します。
• example_target：ターゲットデータを取得します。
• example_molecule：分子データを取得します。
• example_drug：薬物データを取得します。
• その他のデータエンティティ APIs...

化学ツール APIs

• example_canonicalizeSmiles：SMILES 文字列を正規化します。
• example_smiles2inchi：SMILES を InChI に変換します。
• example_smiles2svg：SMILES を SVG 画像に変換します。
• example_structuralAlerts：構造警報情報を取得します。
• その他の化学ツール APIs...

サンプル

各種 API の使用例については、chembl_search.py ファイルを参照してください。

依存関係

📄 ライセンス

MIT