Chembl MCP Server

🚀 ChEMBL-MCP-Server

這是一個基於 chembl_webresource_client 包的 FastMCP 封裝服務器，可提供對 ChEMBL 數據庫的 API 訪問，為相關數據操作帶來便利。

🚀 快速開始

要使用該服務器，你可以按照以下步驟進行安裝和啟動：

安裝

# 克隆倉庫
git clone https://github.com/yourusername/ChEMBL-MCP-Server.git
cd ChEMBL-MCP-Server

# 安裝依賴項
pip install -r requirements.txt

啟動服務器

# 使用默認配置啟動 HTTP 服務器
python chembl_searver.py

# 指定主機和端口
python chembl_searver.py --host 0.0.0.0 --port 8080

# 使用 stdio 傳輸
python chembl_searver.py --transport stdio

# 設置日誌級別
python chembl_searver.py --log-level DEBUG

可用參數

• --host：服務器主機地址，默認為 127.0.0.1
• --port：服務器端口，默認為 8000
• --transport：傳輸方法，可選 http 或 stdio，默認為 http
• --log-level：日誌級別，可選 DEBUG、INFO、WARNING、ERROR、CRITICAL，默認為 INFO

✨ 主要特性

• 對 ChEMBL 數據庫進行全面的 API 訪問。
• 使用 FastMCP 框架實現異步 API 調用。
• 內置錯誤處理和超時機制。
• 支持 HTTP 和 stdio 傳輸方法。
• 具備完整的類型註解和文檔字符串。

💻 使用示例

查看 chembl_search.py 文件以瞭解各種 API 的使用示例。

📚 詳細文檔

API 功能

該服務器提供了以下 API 功能：

數據實體 APIs

• example_activity：獲取活動數據
• example_assay：獲取測定數據
• example_target：獲取靶點數據
• example_molecule：獲取分子數據
• example_drug：獲取藥物數據
• 更多數據實體 APIs...

化學工具 APIs

• example_canonicalizeSmiles：規範 SMILES 字符串
• example_smiles2inchi：將 SMILES 轉換為 InChI
• example_smiles2svg：將 SMILES 轉換為 SVG 圖像
• example_structuralAlerts：獲取結構警戒信息
• 更多化學工具 APIs...

依賴項

📄 許可證

MIT