MCP Atomictoolkit

MCPプロトコルに互換性のあるサーバープロジェクトで、ASE、pymatgen、および機械学習原子間ポテンシャル（MLIPs）を通じて原子スケールのシミュレーション機能を提供しています。現在積極的に開発中です。

研究とデータ開発者ツール #原子シミュレーション #MCPプロトコル #機械学習 #構造最適化 .Python

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更新時間 : 2025-04-29

Atomistic Toolkit MCP Serverとは？

これは、ASE（原子シミュレーション環境）とpymatgenに基づくツールサーバーで、原子レベルの材料シミュレーション機能を提供します。ユーザーは分子構造を作成および操作し、幾何学的最適化を行い、さまざまなファイル形式の読み書き操作をサポートします。

Atomistic Toolkit MCP Serverをどのように使用するか？

MCPプロトコルを介してサーバーに接続した後、構造作成要求、最適化命令、またはファイル操作コマンドを送信できます。サーバーは計算結果または処理された構造データを返します。

適用シーン

材料科学研究、分子動力学シミュレーション、結晶構造解析などの分野に適しています。特に原子レベルの精度の計算が必要な研究者に適しています。

主要機能

構造作成と操作さまざまな分子および結晶構造の作成をサポートし、原子位置の調整、格子定数の変更などの機能を提供します。

幾何学的最適化分子または結晶構造のエネルギー最小化計算を行い、最も安定した構造を見つけます。

ファイル入出力操作CIF、POSCAR、XYZなどの一般的な構造ファイル形式の読み書きをサポートします。

利点と制限

利点

複数の原子シミュレーションツール（ASE、pymatgen）を統合

機械学習原子間ポテンシャル（MLIPs）をサポート

標準MCPプロトコルを介して容易に統合可能

制限

プロジェクトはまだ積極的に開発中であり、一部の機能は不安定な場合があります。

一定の計算リソースが必要です。

非専門ユーザーにとって学習曲線が急です。

使い方

接続を確立

MCPプロトコルを介してサーバーに接続します。

要求を送信

構造作成または計算要求を送信します。

結果を取得

サーバーから返された計算結果を受信して処理します。

使用例

シリコン結晶構造の作成ダイヤモンド構造のシリコン結晶を作成し、幾何学的最適化を行います。

分子構造の最適化有機分子の構造最適化を行い、最低エネルギー構造を見つけます。

よくある質問

このサーバーはどのようなファイル形式をサポートしていますか？

計算にはどれくらいの時間がかかりますか？

どの機能が利用可能かをどうやって知ることができますか？

関連リソース

ASEドキュメント

原子シミュレーション環境（ASE）の公式ドキュメント

pymatgenドキュメント

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MCPプロトコルの説明

Model Context Protocolの公式説明

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