MCP Atomictoolkit

MCP Atomictoolkit

一個兼容MCP協議的服務器項目，通過ASE、pymatgen和機器學習原子間勢能（MLIPs）提供原子尺度模擬功能，目前正在積極開發中。

研究與數據開發者工具 #原子模擬 #MCP協議 #機器學習 #結構優化 .Python

評分 : 2.5分

下載量 : 5.9K

更新時間 : 2025-04-29

什麼是Atomistic Toolkit MCP Server?

這是一個基於ASE(原子模擬環境)和pymatgen的工具服務器，提供原子級材料模擬功能。它允許用戶創建和操作分子結構，進行幾何優化，並支持多種文件格式的讀寫操作。

如何使用Atomistic Toolkit MCP Server?

通過MCP協議與服務器建立連接後，您可以發送結構創建請求、優化指令或文件操作命令。服務器會返回計算結果或處理後的結構數據。

適用場景

適用於材料科學研究、分子動力學模擬、晶體結構分析等領域。特別適合需要原子級精度計算的研究人員。

主要功能

結構創建與操作

支持創建各種分子和晶體結構，並提供原子位置調整、晶格參數修改等功能

幾何優化

對分子或晶體結構進行能量最小化計算，找到最穩定的構型

文件I/O操作

支持多種格式的結構文件讀寫，包括CIF、POSCAR、XYZ等常見格式

優勢

集成多種原子模擬工具(ASE, pymatgen)

支持機器學習原子間勢(MLIPs)

通過標準MCP協議易於集成

侷限性

項目仍在積極開發中，部分功能可能不穩定

需要一定的計算資源支持

對非專業用戶學習曲線較陡

如何使用

建立連接

通過MCP協議與服務器建立連接

發送請求

發送結構創建或計算請求

獲取結果

接收並處理服務器返回的計算結果

使用案例

創建硅晶體結構

創建一個金剛石結構的硅晶體，並進行幾何優化

分子結構優化

對有機分子進行結構優化，尋找最低能量構型

常見問題

這個服務器支持哪些文件格式?

計算需要多長時間?

如何知道哪些功能已經可用?

相關資源

ASE文檔

原子模擬環境(ASE)官方文檔

pymatgen文檔

pymatgen材料分析庫文檔

MCP協議說明

Model Context Protocol官方說明

Markdownify MCP

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