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MCP Atomictoolkit
什麼是Atomistic Toolkit MCP Server?
這是一個基於ASE(原子模擬環境)和pymatgen的工具服務器，提供原子級材料模擬功能。它允許用戶創建和操作分子結構，進行幾何優化，並支持多種文件格式的讀寫操作。如何使用Atomistic Toolkit MCP Server?
通過MCP協議與服務器建立連接後，您可以發送結構創建請求、優化指令或文件操作命令。服務器會返回計算結果或處理後的結構數據。適用場景
適用於材料科學研究、分子動力學模擬、晶體結構分析等領域。特別適合需要原子級精度計算的研究人員。主要功能
結構創建與操作支持創建各種分子和晶體結構，並提供原子位置調整、晶格參數修改等功能
幾何優化對分子或晶體結構進行能量最小化計算，找到最穩定的構型
文件I/O操作支持多種格式的結構文件讀寫，包括CIF、POSCAR、XYZ等常見格式
優勢與侷限性
優勢
集成多種原子模擬工具(ASE, pymatgen)
支持機器學習原子間勢(MLIPs)
通過標準MCP協議易於集成
侷限性
項目仍在積極開發中，部分功能可能不穩定
需要一定的計算資源支持
對非專業用戶學習曲線較陡
如何使用
建立連接
通過MCP協議與服務器建立連接
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發送請求
發送結構創建或計算請求
獲取結果
接收並處理服務器返回的計算結果
使用案例
創建硅晶體結構創建一個金剛石結構的硅晶體，並進行幾何優化
分子結構優化對有機分子進行結構優化，尋找最低能量構型
常見問題
這個服務器支持哪些文件格式?
計算需要多長時間?
如何知道哪些功能已經可用?
相關資源
ASE文檔
原子模擬環境(ASE)官方文檔
pymatgen文檔
pymatgen材料分析庫文檔
MCP協議說明
Model Context Protocol官方說明
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