Pubcrawl

🚀 PubCrawl

PubCrawl是一個 MCP服務器，它使大語言模型（LLM）客戶端能夠訪問PubMed、FDA藥品標籤、英國藥品數據以及ClinicalTrials.gov的數據。這就像是一場經過同行評審的文獻、標籤和試驗的探索之旅。

本項目由 PharmaTools.AI 開發。

✨ 主要特性

文獻相關工具

藥品標籤相關工具

臨床試驗相關工具

📦 安裝指南

前提條件

• Node.js 20 及以上版本
• 兼容 MCP 的客戶端（如 Claude Desktop、Cursor 等）

通過 npm 安裝

npm install -g @pharmatools/pubcrawl

配置 Claude Desktop

將以下內容添加到 claude_desktop_config.json 文件中：

• macOS：~/Library/Application Support/Claude/claude_desktop_config.json
• Windows：%APPDATA%\Claude\claude_desktop_config.json

{
  "mcpServers": {
    "pubcrawl": {
      "command": "pubcrawl"
    }
  }
}

重啟 Claude Desktop。PubCrawl 將出現在 + → 連接器 下。

從源代碼安裝

git clone https://github.com/nickjlamb/pubcrawl.git
cd pubcrawl
npm install
npm run build

然後在配置文件中指向構建後的文件：

{
  "mcpServers": {
    "pubcrawl": {
      "command": "node",
      "args": ["/path/to/pubcrawl/dist/index.js"]
    }
  }
}

NCBI API 密鑰（可選）

如果沒有 API 密鑰，請求速率將限制為每秒 3 次；有了 API 密鑰，請求速率可達到每秒 10 次。

1. 在 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/account/ 創建一個免費的 NCBI 賬戶。
2. 轉到賬戶設置 → API 密鑰管理。
3. 將密鑰添加到配置文件中：

{
  "mcpServers": {
    "pubcrawl": {
      "command": "pubcrawl",
      "env": {
        "NCBI_API_KEY": "your_key_here"
      }
    }
  }
}

💻 使用示例

基礎用法

連接成功後，只需自然地提問即可，例如：

• "Search PubMed for recent clinical trials on semaglutide"（在 PubMed 上搜索關於司美格魯肽的近期臨床試驗）
• "Get the abstract for PMID 38127654"（獲取 PMID 為 38127654 的文章摘要）
• "Find papers related to this one and format citations in APA"（查找與這篇文章相關的論文，並以 APA 格式生成引用）
• "What are the trending papers on CRISPR gene therapy this month?"（本月關於 CRISPR 基因療法的熱門論文有哪些？）
• "Get the full text of that paper from PMC"（從 PubMed Central 獲取那篇論文的全文）
• "Get the FDA prescribing information for metformin — just the indications and warnings"（獲取二甲雙胍的 FDA 處方信息，僅需適應症和警告部分）
• "Pull the UK SmPC for atorvastatin"（獲取阿託伐他汀的英國藥品特性摘要）
• "Compare US and UK labelling for lisinopril"（比較賴諾普利的美國和英國標籤）
• "What drugs are approved for type 2 diabetes?"（哪些藥物被批准用於治療 2 型糖尿病？）
• "Find recruiting Phase 3 trials for pembrolizumab in breast cancer"（查找正在招募的帕博利珠單抗治療乳腺癌的 3 期臨床試驗）
• "Get details on clinical trial NCT03086486"（獲取臨床試驗 NCT03086486 的詳細信息）

開發相關

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📄 許可證

本項目採用 MIT 許可證。