Pubcrawl

🚀 PubCrawl

PubCrawl是一个 MCP服务器，它使大语言模型（LLM）客户端能够访问PubMed、FDA药品标签、英国药品数据以及ClinicalTrials.gov的数据。这就像是一场经过同行评审的文献、标签和试验的探索之旅。

本项目由 PharmaTools.AI 开发。

✨ 主要特性

文献相关工具

药品标签相关工具

临床试验相关工具

📦 安装指南

前提条件

• Node.js 20 及以上版本
• 兼容 MCP 的客户端（如 Claude Desktop、Cursor 等）

通过 npm 安装

npm install -g @pharmatools/pubcrawl

配置 Claude Desktop

将以下内容添加到 claude_desktop_config.json 文件中：

• macOS：~/Library/Application Support/Claude/claude_desktop_config.json
• Windows：%APPDATA%\Claude\claude_desktop_config.json

{
  "mcpServers": {
    "pubcrawl": {
      "command": "pubcrawl"
    }
  }
}

重启 Claude Desktop。PubCrawl 将出现在 + → 连接器 下。

从源代码安装

git clone https://github.com/nickjlamb/pubcrawl.git
cd pubcrawl
npm install
npm run build

然后在配置文件中指向构建后的文件：

{
  "mcpServers": {
    "pubcrawl": {
      "command": "node",
      "args": ["/path/to/pubcrawl/dist/index.js"]
    }
  }
}

NCBI API 密钥（可选）

如果没有 API 密钥，请求速率将限制为每秒 3 次；有了 API 密钥，请求速率可达到每秒 10 次。

1. 在 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/account/ 创建一个免费的 NCBI 账户。
2. 转到账户设置 → API 密钥管理。
3. 将密钥添加到配置文件中：

{
  "mcpServers": {
    "pubcrawl": {
      "command": "pubcrawl",
      "env": {
        "NCBI_API_KEY": "your_key_here"
      }
    }
  }
}

💻 使用示例

基础用法

连接成功后，只需自然地提问即可，例如：

• "Search PubMed for recent clinical trials on semaglutide"（在 PubMed 上搜索关于司美格鲁肽的近期临床试验）
• "Get the abstract for PMID 38127654"（获取 PMID 为 38127654 的文章摘要）
• "Find papers related to this one and format citations in APA"（查找与这篇文章相关的论文，并以 APA 格式生成引用）
• "What are the trending papers on CRISPR gene therapy this month?"（本月关于 CRISPR 基因疗法的热门论文有哪些？）
• "Get the full text of that paper from PMC"（从 PubMed Central 获取那篇论文的全文）
• "Get the FDA prescribing information for metformin — just the indications and warnings"（获取二甲双胍的 FDA 处方信息，仅需适应症和警告部分）
• "Pull the UK SmPC for atorvastatin"（获取阿托伐他汀的英国药品特性摘要）
• "Compare US and UK labelling for lisinopril"（比较赖诺普利的美国和英国标签）
• "What drugs are approved for type 2 diabetes?"（哪些药物被批准用于治疗 2 型糖尿病？）
• "Find recruiting Phase 3 trials for pembrolizumab in breast cancer"（查找正在招募的帕博利珠单抗治疗乳腺癌的 3 期临床试验）
• "Get details on clinical trial NCT03086486"（获取临床试验 NCT03086486 的详细信息）

开发相关

npm run dev    # TypeScript 监听模式
npm run build  # 编译到 dist/ 目录
npm start      # 运行服务器

📄 许可证

本项目采用 MIT 许可证。