MCP Simple Pubmed

🚀 簡單的PubMed MCP 服務器

這是一個通過Entrez API提供對PubMed文章訪問的MCP服務器，能讓你便捷地搜索PubMed數據庫、訪問文章摘要以及下載開放獲取的文章全文。

✨ 主要特性

• 🔍 使用關鍵詞搜索PubMed數據庫。
• 📖 訪問文章摘要。
• 📥 下載全文（當文章在PubMed上開放獲取時）。

請注意，工具返回的是XML格式的全文，這對於AI來說更有用，因為它提供了文檔結構的額外信息，至少，這是Claude 3.5 Sonnet所偏好的。

此外，該工具和其他工具可能無法提供論文全文並不一定意味著論文不可用。在測試該工具時，遇到過一篇沒有全文在PubMed上的論文，Claude通過DOI訪問出版URL時得到了“禁止”錯誤，但使用常規瀏覽器卻能訪問同一頁面。

簡而言之，如果你的AI助手無法通過此工具獲得論文全文，請嘗試手動使用常規瀏覽器訪問。

最後，該工具當然無法提供對付費期刊文章的訪問。你可能需要通過你的圖書館資源或——作為最後手段——通過一個旨在使公開資助的研究免費提供的網站來閱讀它們。

⚠️ 重要提示

工具返回的是XML格式的全文，適合AI使用；工具無法提供全文不代表論文不可用；工具無法提供對付費期刊文章的訪問。

💡 使用建議

若AI助手無法獲取論文全文，可嘗試手動用常規瀏覽器訪問；對付費期刊文章，可通過圖書館資源或相關免費網站閱讀。

📦 安裝指南

通過Smithery安裝

要自動通過Smithery安裝Simple PubMed for Claude Desktop，可使用以下命令：

npx -y @smithery/cli install mcp-simple-pubmed --client claude

手動安裝

pip install mcp-simple-pubmed

🔧 技術細節

服務器需要以下環境變量：

• PUBMED_EMAIL：你的電子郵件地址（NCBI要求）
• PUBMED_API_KEY：可選的API密鑰，用於更高的速率限制

標準速率為3請求/秒。未實施速率限制，因為通常情況下不太可能AI生成的流量超過此限制。如果你需要，可以註冊一個API密鑰以獲得10請求/秒的速率。閱讀NCBI頁面上的相關內容。

💻 使用示例

與Claude Desktop一起使用

將以下內容添加到你的Claude Desktop配置文件（claude_desktop_config.json）中：

（Mac OS）

{
  "mcpServers": {
    "simple-pubmed": {
      "command": "python",
      "args": ["-m", "mcp_simple_pubmed"],
      "env": {
        "PUBMED_EMAIL": "your-email@example.com",
        "PUBMED_API_KEY": "your-api-key" 
      }
    }
  }
}

（Windows）

{
  "mcpServers": {
    "simple-pubmed": {
      "command": "C:\\Users\\YOUR_USERNAME\\AppData\\Local\\Programs\\Python\\Python311\\python.exe",
      "args": [
        "-m",
        "mcp_simple_pubmed"
      ],
      "env": {
        "PUBMED_EMAIL": "your-email@example.com",
        "PUBMED_API_KEY": "your-api-key" 
      }
    }
  }
}

📄 許可證

MIT License