MCP Simple Pubmed

🚀 シンプルなPubMed MCPサーバー

このサーバーは、Entrez APIを通じてPubMedの記事にアクセスできるMCPサーバーです。

✨ 主な機能

• キーワードを使用してPubMedデータベースを検索することができます。
• 記事の要約にアクセスできます。
• 記事がPubMed上でオープンアクセスの場合、全文をダウンロードできます。

⚠️ 重要提示

このツールはXML形式の全文を返します。これは、文書構造に関する追加情報を提供するため、AIにとってより有用です。少なくとも、Claude 3.5 Sonnetはこの形式を好みます。

また、このツールや他のツールが論文の全文を提供できない場合、必ずしも論文が利用できないことを意味しません。このツールをテストしているとき、私はPubMed上に全文がない論文に遭遇しましたが、ClaudeがDOIを介して出版URLにアクセスしたときに「禁止」エラーが発生しました。しかし、私は通常のブラウザで同じページにアクセスすることができました。

簡単に言えば、AIアシスタントがこのツールを通じて論文の全文を取得できない場合は、通常のブラウザを使用して手動でアクセスしてみてください。

最後に、このツールは有料のジャーナル記事へのアクセスを提供することはできません。あなたは、図書館のリソースを通じて、または最終手段として、公的資金による研究を無料で提供することを目的としたウェブサイトを通じて、それらを読む必要があるかもしれません。

📦 インストール

Smithery経由でのインストール

Smitheryを通じてSimple PubMed for Claude Desktopを自動的にインストールするには、以下のコマンドを実行します。

npx -y @smithery/cli install mcp-simple-pubmed --client claude

手動インストール

pip install mcp-simple-pubmed

🔧 設定

サーバーには以下の環境変数が必要です。

標準レートは3リクエスト/秒です。通常、AIによるトラフィックがこの制限を超えることはあまりないため、レート制限は実装されていません。必要な場合は、APIキーを登録して10リクエスト/秒のレートを得ることができます。NCBIのページの関連内容を読んでください。

💻 使用例

基本的な使用法

Claude Desktopと一緒に使用するには、Claude Desktopの設定ファイル（claude_desktop_config.json）に以下の内容を追加します。

（Mac OS）

{
  "mcpServers": {
    "simple-pubmed": {
      "command": "python",
      "args": ["-m", "mcp_simple_pubmed"],
      "env": {
        "PUBMED_EMAIL": "your-email@example.com",
        "PUBMED_API_KEY": "your-api-key" 
      }
    }
  }
}

（Windows）

{
  "mcpServers": {
    "simple-pubmed": {
      "command": "C:\\Users\\YOUR_USERNAME\\AppData\\Local\\Programs\\Python\\Python311\\python.exe",
      "args": [
        "-m",
        "mcp_simple_pubmed"
      ],
      "env": {
        "PUBMED_EMAIL": "your-email@example.com",
        "PUBMED_API_KEY": "your-api-key" 
      }
    }
  }
}

📄 ライセンス

MIT License