Pubmed MCP Smithery

🚀 增強PubMed搜索MCP服務器

一個提供增強工具以從PubMed數據庫中搜索和檢索學術論文的Model Content Protocol（MCP）服務器，具有額外功能，如MeSH術語查找、出版物數量統計以及基於PICO的證據搜索，能助力用戶高效獲取學術資源。

🚀 快速開始

增強PubMed搜索MCP服務器可幫助用戶從PubMed數據庫搜索和檢索學術論文，具備MeSH術語查找、出版物數量統計等額外功能。

✨ 主要特性

• 通過關鍵詞搜索PubMed，可選期刊過濾
• 支持按相關性或日期（newest/oldest first）排序結果
• 獲取與搜索詞相關的MeSH（醫學主題詞）
• 獲取多個搜索詞的出版物數量（用於比較流行度）
• 檢索論文詳細信息，包括摘要、DOI、作者和關鍵詞
• 支持PICO（人群、干預、對照、結局）結構化搜索，支持同義詞和組合查詢

📦 安裝指南

先決條件

• Python 3.6+
• pip

安裝步驟

1. 克隆此倉庫：

git clone https://github.com/leescot/pubmed-mcp-smithery
cd pubmed-mcp-smithery

2. 安裝依賴項：

pip install fastmcp requests

💻 使用示例

本地運行

啟動服務器：

python pubmed_enhanced_mcp_server.py

開發模式（自動重載）：

mcp dev pubmed_enhanced_mcp_server.py

添加到Claude Desktop

編輯你的Claude Desktop配置文件(CLAUDE_DIRECTORY/claude_desktop_config.json)以添加此服務器：

"pubmed-enhanced": {
    "command": "python",
    "args": [
        "/path/pubmed-mcp-smithery(pubmed_enhanced_mcp_server.py"
    ]
}

基礎用法

該服務器提供以下主要功能：

1. search_pubmed - 根據關鍵詞搜索PubMed文章，可選期刊過濾

# 示例
results = await search_pubmed(
    keywords=["糖尿病", "胰島素抵抗"],
    journal="Nature Medicine",
    num_results=5,
    sort_by="date_desc"
)

2. get_mesh_terms - 查找與醫學概念相關的MeSH術語

# 示例
mesh_terms = await get_mesh_terms("糖尿病")

3. get_pubmed_count - 獲取多個搜索詞的出版物數量

# 示例
counts = await get_pubmed_count(["糖尿病", "肥胖症", "高血壓"])

4. format_paper_details - 根據PMID獲取特定論文的詳細信息

# 示例
paper_details = await format_paper_details(["12345678", "87654321"])

5. pico_search - 基於PICO（人群、干預、對照、結局）的結構化搜索，支持同義詞和組合查詢

# 示例
pico_results = await pico_search(
    p_terms=["糖尿病患者", "非糖尿病患者"],
    i_terms=["二甲雙胍"],
    c_terms=["安慰劑"],
    o_terms=["血糖水平"]
)

📚 詳細文檔

⚠️ 重要提示

代碼示例中的參數需根據實際需求調整。

💡 使用建議

PICO搜索功能支持複雜的醫學查詢，通過指定人群（p_terms）、干預（i_terms）、對照（c_terms）和結局（o_terms）進行高級篩選。

📄 許可證

該軟件受[許可證名稱]許可，具體內容請參考項目倉庫。