Pubmed MCP Smithery

🚀 強化PubMed検索MCPサーバー

このサーバーは、Model Content Protocol（MCP）に基づき、PubMedデータベースから学術論文を検索および取得するための強化ツールを提供します。MeSH用語検索、出版物数の統計、PICOに基づくエビデンス検索などの追加機能を備えています。

✨ 主な機能

• キーワードによるPubMed検索、オプションでのジャーナルフィルタリング
• 検索結果を関連性または日付（最新/最古順）でソートする機能
• 検索語に関連するMeSH（医学主題語）の取得
• 複数の検索語の出版物数の取得（人気比較用）
• 論文の詳細情報（要約、DOI、著者、キーワードなど）の取得
• PICO（対象者、介入、比較、アウトカム）に基づく構造化検索のサポート、同義語および組み合わせクエリのサポート

📦 インストール

前提条件

• Python 3.6以上
• pip

インストール手順

1. このリポジトリをクローンします：

   git clone https://github.com/leescot/pubmed-mcp-smithery
   cd pubmed-mcp-smithery
   

2. 依存関係をインストールします：

   pip install fastmcp requests
   

💻 使用例

基本的な使用法

ローカルでの実行

サーバーを起動します：

python pubmed_enhanced_mcp_server.py

開発モード（自動リロード）：

mcp dev pubmed_enhanced_mcp_server.py

Claude Desktopへの追加

Claude Desktopの設定ファイル（CLAUDE_DIRECTORY/claude_desktop_config.json）を編集して、このサーバーを追加します：

"pubmed-enhanced": {
    "command": "python",
    "args": [
        "/path/pubmed-mcp-smithery(pubmed_enhanced_mcp_server.py"
    ]
}

高度な使用法

このサーバーは以下の主要な機能を提供します：

search_pubmed - キーワードに基づくPubMed記事の検索、オプションでのジャーナルフィルタリング

# 例
results = await search_pubmed(
    keywords=["糖尿病", "インスリン抵抗性"],
    journal="Nature Medicine",
    num_results=5,
    sort_by="date_desc"
)

get_mesh_terms - 医学概念に関連するMeSH用語の検索

# 例
mesh_terms = await get_mesh_terms("糖尿病")

get_pubmed_count - 複数の検索語の出版物数の取得

# 例
counts = await get_pubmed_count(["糖尿病", "肥満症", "高血圧"])

format_paper_details - PMIDに基づく特定の論文の詳細情報の取得

# 例
paper_details = await format_paper_details(["12345678", "87654321"])

pico_search - PICO（対象者、介入、比較、アウトカム）に基づく構造化検索、同義語および組み合わせクエリのサポート

# 例
pico_results = await pico_search(
    p_terms=["糖尿病患者", "非糖尿病患者"],
    i_terms=["メトホルミン"],
    c_terms=["プラセボ"],
    o_terms=["血糖値"]
)

🔧 注意事項

⚠️ 重要提示

コード例のパラメータは実際のニーズに合わせて調整する必要があります。

💡 使用建议

PICO検索機能は複雑な医学的クエリをサポートしており、対象者（p_terms）、介入（i_terms）、比較（c_terms）、アウトカム（o_terms）を指定することで高度なフィルタリングが可能です。

📄 ライセンス

このソフトウェアは[ライセンス名]の下で提供されています。詳細については、プロジェクトのリポジトリを参照してください。