MCP Server Lims

🚀 MCP 服务器 LIMS

MCP 服务器 LIMS 的目标是打造一个完整的实验室信息管理系统 (LIMS)，用于管理从样品接收到数据分析的全流程，提升实验室管理的效率与准确性。

🚀 快速开始

若你想使用 MCP 服务器 LIMS，可按以下步骤进行构建与运行：

1. 克隆仓库

$ git clone https://github.com/sheffler/mcp-server-lims

2. 初始化环境

$ cd mcp-server-lims
$ uv init
$ uv venv
$ . .venv/bin/activate

3. 安装依赖

$ uv sync

✨ 主要特性

1. 样品接收与登记
   • 将样品的基本信息（如名称、来源等）录入系统。
2. 准备步骤
   • 使用 MCP 工具对样品进行处理，包括附加标签和监控“通过”或“失败”的状态。
3. 分析步骤
   • 对准备步骤中状态为“通过”的样品进行分析。
4. 报告生成
   • 生成包含所有前三步数据的综合报告。

🔧 技术细节

• 使用 Python 开发服务器端代码，保证代码的灵活性与可维护性。
• 采用 SQLite 数据库存储和管理样品信息及实验数据，方便数据的存储与查询。
• 提供 RESTful API 接口，便于与其他系统集成，实现数据的共享与交互。

💻 使用示例

配置示例

Claude Desktop 配置

编辑 ~/Library/Application Support/Claude/claude_desktop_config.json，添加以下内容：

{
    "mcpServers": {
        "mcp-lims-server": {
            "command": "/Users/sheffler/git/mcp-server-lims/.venv/bin/python",
            "args": [
                "/Users/sheffler/git/mcp-server-lims/lims_server.py"
            ]
        },
        "sqlite": {
            "command": "/Users/sheffler/.local/bin/uvx",
            "args": [
                "mcp-server-sqlite",
                "--db-path",
                "/Users/sheffler/test.db"
            ]
        }
    }
}

Oterm 配置

编辑 ~/Library/Application Support/oterm/config.json，添加以下内容：

{
    "theme": "textual-dark",
    "splash-screen": false,
    "mcpServers": {
        "mcp-lims-server": {
            "command": "/Users/sheffler/git/mcp-server-lims/.venv/bin/python",
            "args": [
                "/Users/sheffler/git/mcp-server-lims/lims_server.py"
            ]
        },
        "sqlite": {
            "command": "/Users/sheffler/.local/bin/uvx",
            "args": [
                "mcp-server-sqlite",
                "--db-path",
                "/Users/sheffler/test.db"
            ]
        }
    }
}

示例报告

Claude Desktop 生成的示例报告如下图所示：