MCP Server Lims

🚀 MCP 服務器 LIMS

MCP 服務器 LIMS 致力於實現一個完整的實驗室信息管理系統 (LIMS)，可對從樣品接收到數據分析的全流程進行有效管理。

🚀 快速開始

構建與運行步驟

1. 克隆倉庫

   $ git clone https://github.com/sheffler/mcp-server-lims
   

2. 初始化環境

   $ cd mcp-server-lims
   $ uv init
   $ uv venv
   $ . .venv/bin/activate
   

3. 安裝依賴

   $ uv sync
   

✨ 主要特性

1. 樣品接收與登記
   • 可將樣品的基本信息（如名稱、來源等）錄入系統。
2. 準備步驟
   • 運用 MCP 工具對樣品進行處理，涵蓋附加標籤以及監控“通過”或“失敗”的狀態。
3. 分析步驟
   • 針對準備步驟中狀態為“通過”的樣品展開分析。
4. 報告生成
   • 生成包含前三步所有數據的綜合報告。

🔧 技術細節

• 服務器端代碼採用 Python 進行開發。
• 藉助 SQLite 數據庫來存儲和管理樣品信息及實驗數據。
• 提供 RESTful API 接口，方便與其他系統進行集成。

💻 使用示例

配置示例

Claude Desktop 配置

編輯 ~/Library/Application Support/Claude/claude_desktop_config.json，添加以下內容：

{
    "mcpServers": {
        "mcp-lims-server": {
            "command": "/Users/sheffler/git/mcp-server-lims/.venv/bin/python",
            "args": [
                "/Users/sheffler/git/mcp-server-lims/lims_server.py"
            ]
        },
        "sqlite": {
            "command": "/Users/sheffler/.local/bin/uvx",
            "args": [
                "mcp-server-sqlite",
                "--db-path",
                "/Users/sheffler/test.db"
            ]
        }
    }
}

Oterm 配置

編輯 ~/Library/Application Support/oterm/config.json，添加以下內容：

{
    "theme": "textual-dark",
    "splash-screen": false,
    "mcpServers": {
        "mcp-lims-server": {
            "command": "/Users/sheffler/git/mcp-server-lims/.venv/bin/python",
            "args": [
                "/Users/sheffler/git/mcp-server-lims/lims_server.py"
            ]
        },
        "sqlite": {
            "command": "/Users/sheffler/.local/bin/uvx",
            "args": [
                "mcp-server-sqlite",
                "--db-path",
                "/Users/sheffler/test.db"
            ]
        }
    }
}

示例報告

Claude Desktop 生成的示例報告如下圖所示：