Biorxiv

🚀 bioRxiv MCP サーバー

🔍 AI アシスタントがシンプルな MCP インターフェースを通じて、bioRxiv 上の論文を検索しアクセスできるようにします。

bioRxiv MCP サーバーは、AI モデルに対して、モデルコンテキストプロトコル (MCP) を介して、生物科学のプレプリントリポジトリである bioRxiv に接続する橋渡しを行います。これにより、AI はプログラムで生物科学分野のプレプリントを検索し、そのメタデータを取得することができます。

🤝 貢献 • 📝 問題報告

✨ 主な機能

• 🔎 論文検索：キーワードまたは高度な検索クエリを使用して、bioRxiv 上の論文を検索できます ✅
• 🚀 高速検索：論文のメタデータにすばやくアクセスできます ✅
• 📊 メタデータ取得：特定の論文の詳細情報を取得できます ✅
• 📊 研究支援：生物科学の研究と分析を促進します ✅
• 📄 論文アクセス：論文の内容をダウンロードして閲覧できます 📝
• 📋 論文リスト：すべてのダウンロード済み論文を表示できます 📝
• 🗃️ ローカル保存：論文をローカルに保存して、より高速なアクセスを実現します 📝
• 📝 研究ヒント：論文分析に特化した一連のヒント文が用意されています 📝

🚀 クイックスタート

前提条件

• Python 3.10+
• FastMCP ライブラリ

インストール手順

1. リポジトリをクローンします：

   git clone https://github.com/JackKuo666/bioRxiv-MCP-Server.git
   cd bioRxiv-MCP-Server
   

2. 必要な依存関係をインストールします：

   pip install -r requirements.txt
   

Smithery を通じたインストール

Claude Desktop に bioRxiv Server を自動的にインストールするには、Smithery を通じて実行します。

claude

npx -p jackkuo666/bioRxiv-MCP-Server

windows

setx path "%path%;C:\Program Files\Python310\Scripts"
bioRxiv-MCP-Server

linux

export PATH="/usr/local/bin:$PATH" && bioRxiv-MCP-Server

使用方法

インストールが完了したら、以下のコマンドでサーバーを起動できます：

python biorxiv_mcp_server.py

📋 プロジェクト構成

.
├── README.md              # プロジェクトドキュメント
├── biorxiv_web_search.py   # bioRxiv のウェブスクレイピングロジックを含むファイル
└── requirements.txt       # 依存関係管理ファイル

🔧 技術詳細

依存関係

• Python 3.10+
• FastMCP
• asyncio
• logging

🤝 貢献

貢献を歓迎します！自由に Pull Request を送信してください。

📄 ライセンス

このプロジェクトは MIT ライセンスの下で提供されています。

⚠️ 免責事項

このツールは研究目的のみで使用されることを前提としています。bioRxiv のサービス利用規約を尊重し、責任を持ってこのツールを使用してください。