Jackkuo666 Biorxiv MCP Server

🚀 bioRxiv MCP サーバー

🔍 AI アシスタントがシンプルな MCP インターフェースを通じて bioRxiv 論文を検索し、アクセスできるようにします。

bioRxiv MCP サーバーは、AI モデルと bioRxiv プレプリントリポジトリの間に架ける橋となり、モデルコンテキストプロトコル (MCP) を通じてプログラムによる検索とアクセスを実現します。これにより、AI は生物学のプレプリントとそのメタデータを迅速に検索することができます。

🤝 貢献 • 📝 問題の報告

✨ 主な機能

• 🔎 論文検索：キーワードまたは高度な検索クエリを使用して bioRxiv 論文を検索 ✅
• 🚀 効率的な検索：論文のメタデータに迅速にアクセス ✅
• 📊 メタデータアクセス：特定の論文の詳細情報を取得 ✅
• 📊 研究サポート：生物科学の研究と分析を促進 ✅
• 📄 論文アクセス：論文の内容をダウンロードして閲読 📝
• 📋 論文リスト：すべてのダウンロード済み論文を表示 📝
• 🗃️ ローカルストレージ：ローカルに保存してより高速なアクセスを実現 📝
• 📝 研究ヒント：論文分析用の一連の専用ヒント 📝

🚀 クイックスタート

前提条件

• Python 3.10+
• FastMCP ライブラリ

インストール手順

1. リポジトリをクローンします：

   git clone https://github.com/JackKuo666/bioRxiv-MCP-Server.git
   cd bioRxiv-MCP-Server
   

2. 依存関係をインストールします：

   pip install -r requirements.txt
   

Smithery を通じたインストール

Claude Desktop 用に bioRxiv サーバーを自動的にインストールするには、Smithery を通じて行います：

claude

npx -y @smithery/cli@latest install @JackKuo666/biorxiv-mcp-server --client claude --config "{}"

Cursor

設定で以下の内容を「Cursor 設定」→「MCP」→「新しいサーバーを追加」に貼り付けます：

• Mac/Linux

npx -y @smithery/cli@latest run @JackKuo666/biorxiv-mcp-server --client cursor --config "{}" 

Windsurf

npx -y @smithery/cli@latest install @JackKuo666/biorxiv-mcp-server --client windsurf --config "{}"

CLine

npx -y @smithery/cli@latest install @JackKuo666/biorxiv-mcp-server --client cline --config "{}"

Claude Desktop との連携

claude_desktop_config.json に以下の設定を追加します：

（Mac OS）

{
  "project": {
    "name": "bioRxiv-MCP-Server",
    "description": "A server for accessing bioRxiv papers via MCP protocol."
  }
}

💻 使用例

基本的な使用法

# サーバーの起動
python main.py

# 論文の検索
# 提供された API またはコマンドラインツールを使用して検索

# 論文のアクセス
# MCP インターフェースを通じてダウンロード済みの論文内容を取得

🔧 技術詳細

• Python 3.10 以上と最新バージョンの FastMCP ライブラリのインストールを確認してください。
• 一部のネットワーク環境では、プロキシサーバーの設定が必要になる場合があります。

🤝 貢献

貢献を歓迎します！自由に Pull Request を送信してください。

⚠️ 免責事項

このツールは研究目的のみで使用されることを想定しています。bioRxiv のサービス利用規約を遵守し、責任を持ってこのツールを使用してください。