BioMCPはオープンソースの生物医学AIツールキットで、信頼できるデータソースを接続することで、AIシステムに専門的な生物医学知識を提供します。

PubMed文献検索MCPサービス

BioContextAI知識ベースMCPは、生物医学研究向けに設計されたモデルコンテキストプロトコルサーバーで、AIシステムと生物医学リソース間の標準化された接続層を提供し、複数の生物医学データベースとツールの統合アクセスをサポートします。

OLS MCPサーバーは、大型言語モデルにオントロジ照会サービスを提供するツールで、EBIオントロジ照会サービスAPIに接続することで、AIアシスタントが生物医学分野のオントロジ用語、概念、階層構造を正確に取得するのを支援します。

Pythonの超グラフライブラリで、出所追跡とSQLiteによる永続化をサポートし、多ノードの複雑な関係を表現するのに適しています。知識グラフ、AIエージェントのメモリ、生物医学データなどの分野に適用できます。

PubTator MCPサーバーは、PubTator3をベースとした生物医学文献の注釈付けと関係抽出サーバーで、MCPインターフェースを通じてAIアシスタントに文献検索、注釈情報の取得、およびエンティティ関係の分析機能を提供します。

BioMCPは、MCPプロトコルに基づく生物医学研究開発サーバーで、タンパク質データベースと分析ツールを統合することで、大規模言語モデルのタンパク質構造分析分野での能力を強化します。

PubMed MCPサーバーは、Model Context Protocolに基づくインターフェースサービスで、AIエージェントと研究ツールに、PubMedの生物医学文献データベースへの全面的なアクセス機能を提供します。文献検索、メタデータ取得、引用分析、研究計画生成、データ可視化などの機能をサポートし、NCBI E-utilities APIを通じて効率的な統合を実現します。

PubMed MCP Serverは、Model Context Protocol（MCP）を通じてAIアシスタントにPubMed生物医学文献データベースへのアクセスを提供するブリッジサービスで、文献検索、メタデータ取得、深度分析機能をサポートしています。

SPOKEAgentはMCPプロトコルに基づくサーバーで、SPOKE生物医学知識グラフをクエリするために使用され、Cypherクエリの実行とグラフ模式の取得をサポートします。追加の設定なしで、事前に設定されたSPOKEデータベースに接続できます。

生物医学文献データベース用のMCPサーバー

PubTator MCPサーバーは、PubTator3に基づく生物医学文献注釈と関係挖掘サーバーで、MCPプロトコルを通じてAIモデルに科学文献へのプログラムアクセス、注釈情報の取得、エンティティ関係の分析機能を提供します。

精密医療知識グラフ (PrimeKG) をNeo4jデータベースにインポートするプロジェクトで、生物医学データの分析と探索に使用されます。