Primekg MCP

🚀 PrimeKG 至 Neo4j

このプロジェクトは、Precision Medicine Knowledge Graph (PrimeKG) のデータをNeo4jデータベースにインポートし、データ分析と探索に利用するためのものです。

🚀 クイックスタート

このプロジェクトは、PrimeKGのデータをNeo4jデータベースにインポートすることで、データ分析や探索を行うことができます。以下に、主な機能を紹介します。

✨ 主な機能

• PrimeKGデータのダウンロードと処理
• Neo4jグラフデータベースへのデータインポート
• データのクエリと分析に使用するツールの提供

📚 ドキュメント

概要

PrimeKGは、20の高品質な生物医学リソースを統合した包括的な生物医学知識グラフです。これは、17,080種類の疾患とそれらの400万を超える関係を記述し、10の主要な生物学的尺度をカバーしています。

プロジェクト構造

primekg-mcp/
├── config/           # 設定ファイル
├── data/             # データファイル（PrimeKGデータはここに保存されます）
├── docs/             # ドキュメント
├── scripts/          # データ処理ユーティリティスクリプト
├── src/              # ソースコード
│   ├── db/           # データベース接続とクエリ
│   ├── etl/          # データ抽出、変換、ロード
│   └── utils/        # ユーティリティ関数
└── tests/            # テストファイル

設定説明

設定説明は、プロジェクトの進捗に合わせて追加されます。

使用説明

使用説明は、プロジェクトの進捗に合わせて追加されます。

ライセンス情報

ライセンス情報は、後日追加されます。