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Primekg MCP

將精準醫學知識圖譜(PrimeKG)導入Neo4j數據庫的項目,用於生物醫學數據分析和探索。
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什麼是PrimeKG to Neo4j?

這是一個將Precision Medicine Knowledge Graph (PrimeKG)數據導入Neo4j圖形數據庫的項目。PrimeKG整合了20個高質量生物醫學資源,描述了17,080種疾病和超過400萬種關係。

如何使用PrimeKG to Neo4j?

項目提供完整的處理流程:1)下載並處理PrimeKG數據 2)導入Neo4j數據庫 3)提供查詢分析工具

適用場景

適用於生物醫學研究人員、藥物開發人員和數據科學家進行疾病關聯分析、藥物發現和精準醫學研究

主要功能

多源數據整合整合20個高質量生物醫學資源,實現跨資源數據關聯
圖形化展示通過Neo4j提供直觀的圖形界面展示疾病、基因、藥物等實體間複雜關係
靈活查詢分析支持Cypher查詢語言,可執行復雜的關係路徑分析和模式匹配

優勢與侷限性

優勢
整合多個權威生物醫學數據庫,數據質量高
圖形數據庫結構適合展示覆雜生物網絡關係
提供標準化的數據導入流程和查詢接口
侷限性
需要基本的Neo4j和Cypher知識才能充分利用
數據量大,需要足夠的存儲和計算資源
定期更新需要重新導入完整數據集

如何使用

準備環境
安裝Docker和Neo4j數據庫(推薦4.4或更高版本)
下載PrimeKG數據
從項目網站下載最新PrimeKG數據集
數據預處理
運行預處理腳本準備導入數據
導入Neo4j
使用提供的導入工具將處理後的數據導入Neo4j

使用案例

疾病-藥物關聯分析探索特定疾病相關的所有藥物及其作用機制
多跳關係路徑發現發現疾病通過基因、通路等中間實體與其他疾病的潛在關聯

常見問題

需要多少存儲空間來存儲PrimeKG數據?
數據更新頻率如何?
沒有Neo4j經驗可以使用這個項目嗎?

相關資源

PrimeKG官方網站
PrimeKG項目的官方網站,包含數據下載和文檔
Neo4j學習中心
Neo4j官方學習資源,包含Cypher語言教程
項目GitHub倉庫
本項目的源代碼和問題追蹤
安裝
複製以下命令到你的Client進行配置
注意:您的密鑰屬於敏感信息,請勿與任何人分享。
M
MCP Server Airbnb
已認證
Airbnb房源搜索與詳情查詢的MCP服務
TypeScript
235
4分
M
MCP Alchemy
已認證
MCP Alchemy是一個連接Claude Desktop與多種數據庫的工具,支持SQL查詢、數據庫結構分析和數據報告生成。
Python
306
4.2分
P
Postgresql MCP
一個基於FastMCP庫的PostgreSQL數據庫MCP服務,提供對指定表的CRUD操作、模式檢查和自定義SQL查詢功能。
Python
91
4分
A
Awesome MCP List
這是一個持續更新的MCP服務器精選列表,涵蓋了瀏覽器控制、藝術與文化、雲平臺、命令行、通信、客戶數據平臺、數據庫、開發者工具、數據科學工具、文件系統、金融與金融科技、遊戲、知識與記憶、位置服務、營銷、監控、搜索和實用工具等多個類別。每個項目都附帶了GitHub鏈接和星標數量,方便用戶快速瞭解和使用。
699
5分
W
Wren
Wren Engine是一個為MCP客戶端和AI代理設計的語義引擎,提供語義層支持,使AI能準確理解企業數據模型和業務邏輯。它支持多種數據源,嵌入MCP客戶端,確保數據交互的精確性和治理。
Java
387
4分
M
MCP Redis
已認證
Redis MCP Server是一個為Redis設計的自然語言接口服務,支持AI代理通過自然語言查詢和管理Redis數據,集成MCP協議,提供多種數據結構和搜索功能。
Python
66
4.5分
S
Supabase MCP Server
Supabase MCP服務器是一個開源工具,允許IDE安全執行SQL、管理模式變更、調用Supabase管理API和使用Auth Admin SDK,內置安全控制。
Python
769
5分
D
Dbhub
DBHub是一個實現模型上下文協議(MCP)的通用數據庫網關,支持多種數據庫連接和操作。
TypeScript
371
4分
精選MCP服務推薦
M
Markdownify MCP
Markdownify是一個多功能文件轉換服務,支持將PDF、圖片、音頻等多種格式及網頁內容轉換為Markdown格式。
TypeScript
1.7K
5分
B
Baidu Map
已認證
百度地圖MCP Server是國內首個兼容MCP協議的地圖服務,提供地理編碼、路線規劃等10個標準化API接口,支持Python和Typescript快速接入,賦能智能體實現地圖相關功能。
Python
702
4.5分
F
Firecrawl MCP Server
Firecrawl MCP Server是一個集成Firecrawl網頁抓取能力的模型上下文協議服務器,提供豐富的網頁抓取、搜索和內容提取功能。
TypeScript
3.8K
5分
S
Sequential Thinking MCP Server
一個基於MCP協議的結構化思維服務器,通過定義思考階段幫助分解複雜問題並生成總結
Python
257
4.5分
E
Edgeone Pages MCP Server
EdgeOne Pages MCP是一個通過MCP協議快速部署HTML內容到EdgeOne Pages並獲取公開URL的服務
TypeScript
249
4.8分
N
Notion Api MCP
已認證
一個基於Python的MCP服務器,通過Notion API提供高級待辦事項管理和內容組織功能,實現AI模型與Notion的無縫集成。
Python
119
4.5分
M
Magic MCP
Magic Component Platform (MCP) 是一個AI驅動的UI組件生成工具,通過自然語言描述幫助開發者快速創建現代化UI組件,支持多種IDE集成。
JavaScript
1.7K
5分
C
Context7
Context7 MCP是一個為AI編程助手提供即時、版本特定文檔和代碼示例的服務,通過Model Context Protocol直接集成到提示中,解決LLM使用過時信息的問題。
TypeScript
5.2K
4.7分
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