Medixhub

🚀 MedixHubモデルコンテキストプロトコル（MCP）サーバー

MedixHub統合医療および医療保健APIアクセスを備えたModel Context Protocol (MCP)サーバーです。このサーバーは、医療関連の情報を効率的に取得し、処理するための機能を提供します。

✨ 主な機能

• 純粋なJavaScriptで実装されています。
• 標準化されたMCPメタデータを持つ機能を公開します。
• パラメータ検証付きの機能を実行します。
• Ollamaなどの大規模言語モデルとシームレスに統合されます。
• セキュアなAPIエンドポイントを持つ認証機能があります。
• ストリーミング応答をサポートしています。

実装された機能

このサーバーには、JavaScriptで実装された以下の機能が含まれています。

1. executeOpenTargetQuery - OpenTarget APIに対してGraphQLクエリを実行します。
2. FDADrugLabelSearch - FDAデータベースから薬剤情報を取得します。
3. get_drug_generic_name - 一般名とブランド名の間で薬剤名をマッピングします。
4. MonarchSearch - Monarchデータベース内の遺伝子、疾患、または表現型を検索します。
5. MonarchDiseasesForMultiplePhenotypes - 複数の表現型に一致する疾患を見つけます。

OpenTarget機能

• 疾患情報のクエリ
• 薬剤の詳細と関連付け
• ターゲット（遺伝子/タンパク質）情報
• 疾患 - ターゲットの関連付け
• 薬剤 - 疾患の関係

FDA薬剤ラベル機能

• 薬剤情報の検索
• 一般名とブランド名のマッピング
• 有害反応のクエリ
• 薬剤相互作用の検索

Monarchデータベース機能

• 生物医学的エンティティの検索
• 疾患 - 表現型の関連付け
• 遺伝子 - 表現型の関係
• 複数表現型に対する疾患の検索

📦 インストール

前提条件

• Node.js 14以上
• npmまたはyarn

インストール手順

1. リポジトリをクローンします。

git clone https://github.com/yourusername/medixhub-mcp-server.git
cd medixhub-mcp-server

2. 依存関係をインストールします。

npm install

3. 環境変数を設定します。

cp .env.example .env
# .envファイルを編集して設定を行います

4. サーバーを起動します。

npm start

開発用の自動リロードを使用する場合は、以下のコマンドを実行します。

npm run dev

💻 使用例

APIの実行

/executeエンドポイントを使用して、登録されたMedixHub機能を実行できます。

POST /execute
Content-Type: application/json

{
  "name": "queryFDADrugLabel",
  "parameters": {
    "searchFields": {
      "drug_name": ["openfda.brand_name", "openfda.generic_name"]
    },
    "返回值": [
      "generic_name",
      "brand_name"
    ]
  }
}

機能の説明

• executeOpenTargetQuery：OpenTarget APIに対してGraphQLクエリを実行し、薬剤情報を取得します。
• FDADrugLabelSearch：FDAデータベース内の薬剤ラベル情報を検索します。
• get_drug_generic_name：ブランド名から一般名を取得します。
• MonarchSearch：Monarch知識ベース内の遺伝子、疾患、または表現型を検索します。
• MonarchDiseasesForMultiplePhenotypes：複数の表現型に関連する疾患を見つけます。

🔧 技術詳細

プロジェクト構造

medixhub-mcp-server/
├── server.js          # メインサーバーファイル
├── routes/           # APIルート定義
│   ├── openTargetRoutes.js       # OpenTarget関連のルート
│   └── monarchRoutes.js         # Monarch関連のルート
├── controllers/      # コントローラーロジック
│   ├── openTargetController.js  # OpenTargetコントローラー
│   └── monarchController.js     # Monarchコントローラー
└── .env.example       # 環境変数のサンプルファイル

パフォーマンスに関する考慮事項

• すべてのAPI呼び出しは非同期処理で行われます。
• レート制限が有効になっており、乱用を防止します。
• タイムアウト処理があり、リクエストのハングを防止します。
• メモリ使用量が最適化されており、ストリームを効率的に処理します。

📄 ライセンス

このプロジェクトはMITライセンスの下で公開されています。詳細については、LICENSEファイルを参照してください。