Medixhub

🚀 MedixHub模型上下文协议（MCP）服务器

MedixHub模型上下文协议（MCP）服务器集成了医疗和医疗保健API访问功能。它借助标准化的MCP元数据，能执行带参数验证的功能，并与大型语言模型无缝集成，为医疗领域的信息查询和处理提供了高效、安全的解决方案。

✨ 主要特性

• 🔤 采用纯JavaScript实现，便于开发和维护。
• 📄 暴露具有标准化MCP元数据的功能，方便统一管理和调用。
• ✅ 执行带参数验证的功能，确保数据输入的准确性。
• 🤝 与Ollama等大型语言模型无缝集成，拓展应用场景。
• 🔒 带有安全API端点的身份验证，保障数据安全。
• ⚡ 支持流式响应，提高数据传输效率。

📦 安装指南

先决条件

• Node.js 14或更高版本
• npm或yarn

安装步骤

1. 克隆仓库

git clone https://github.com/yourusername/medixhub-mcp-server.git
cd medixhub-mcp-server

2. 安装依赖项

npm install

3. 配置环境变量

cp .env.example .env
# 编辑.env文件以设置您的配置

4. 启动服务器

npm start

若用于开发，支持自动重载：

npm run dev

💻 使用示例

基础用法

使用/execute端点运行任何已注册的MedixHub功能：

POST /execute
Content-Type: application/json

{
  "name": "queryFDADrugLabel",
  "parameters": {
    "searchFields": {
      "drug_name": ["openfda.brand_name", "openfda.generic_name"]
    },
    "返回值": [
      "generic_name",
      "brand_name"
    ]
  }
}

功能说明

• executeOpenTargetQuery：对OpenTarget API执行GraphQL查询，可获取疾病信息、药物细节和关联、目标（基因/蛋白质）信息、疾病 - 目标关联、药物 - 疾病关系等。
• FDADrugLabelSearch：搜索FDA数据库中的药物标签信息，包括药物信息搜索、通用名和品牌名映射、不良反应查询、药物相互作用搜索等。
• get_drug_generic_name：在通用名和品牌名之间映射药物名称。
• MonarchSearch：搜索Monarch数据库中的基因、疾病或表型。
• MonarchDiseasesForMultiplePhenotypes：找到与多个表型匹配的疾病。

📚 详细文档

实现的功能

该服务器包含JavaScript实现的以下功能：

1. executeOpenTargetQuery - 对OpenTarget API执行GraphQL查询
2. FDADrugLabelSearch - 从FDA数据库检索药物信息
3. get_drug_generic_name - 在通用名和品牌名之间映射药物名称
4. MonarchSearch - 搜索Monarch数据库中的基因、疾病或表型
5. MonarchDiseasesForMultiplePhenotypes - 找到与多个表型匹配的疾病

OpenTarget功能

• 疾病信息查询
• 药物细节和关联
• 目标（基因/蛋白质）信息
• 疾病 - 目标关联
• 药物 - 疾病关系

FDA药物标签功能

• 药物信息搜索
• 通用名和品牌名映射
• 不良反应查询
• 药物相互作用搜索

Monarch数据库功能

• 生物医学实体搜索
• 疾病 - 表型关联
• 基因 - 表型关系
• 多表型疾病查找

项目结构

medixhub-mcp-server/
├── server.js          # 主服务器文件
├── routes/           # API路由定义
│   ├── openTargetRoutes.js       # OpenTarget相关路由
│   └── monarchRoutes.js         # Monarch相关路由
├── controllers/      # 控制器逻辑
│   ├── openTargetController.js  # OpenTarget控制器
│   └── monarchController.js     # Monarch控制器
└── .env.example       # 环境变量示例文件

性能考虑

• ⏱️ 所有API调用都使用异步处理，提高响应速度。
• 🚫 启用了速率限制以防止滥用，保障系统稳定性。
• ⏰ 超时处理可防止请求挂起，避免资源浪费。
• 💾 内存使用经过优化，以高效处理流，提升系统性能。

📄 许可证

该项目根据MIT许可证发布 - 有关详细信息，请参阅LICENSE文件。