Medixhub

🚀 MedixHub模型上下文協議（MCP）服務器

MedixHub模型上下文協議（MCP）服務器集成了醫療和醫療保健API訪問功能。它藉助標準化的MCP元數據，能執行帶參數驗證的功能，並與大型語言模型無縫集成，為醫療領域的信息查詢和處理提供了高效、安全的解決方案。

✨ 主要特性

• 🔤 採用純JavaScript實現，便於開發和維護。
• 📄 暴露具有標準化MCP元數據的功能，方便統一管理和調用。
• ✅ 執行帶參數驗證的功能，確保數據輸入的準確性。
• 🤝 與Ollama等大型語言模型無縫集成，拓展應用場景。
• 🔒 帶有安全API端點的身份驗證，保障數據安全。
• ⚡ 支持流式響應，提高數據傳輸效率。

📦 安裝指南

先決條件

• Node.js 14或更高版本
• npm或yarn

安裝步驟

1. 克隆倉庫

git clone https://github.com/yourusername/medixhub-mcp-server.git
cd medixhub-mcp-server

2. 安裝依賴項

npm install

3. 配置環境變量

cp .env.example .env
# 編輯.env文件以設置您的配置

4. 啟動服務器

npm start

若用於開發，支持自動重載：

npm run dev

💻 使用示例

基礎用法

使用/execute端點運行任何已註冊的MedixHub功能：

POST /execute
Content-Type: application/json

{
  "name": "queryFDADrugLabel",
  "parameters": {
    "searchFields": {
      "drug_name": ["openfda.brand_name", "openfda.generic_name"]
    },
    "返回值": [
      "generic_name",
      "brand_name"
    ]
  }
}

功能說明

• executeOpenTargetQuery：對OpenTarget API執行GraphQL查詢，可獲取疾病信息、藥物細節和關聯、目標（基因/蛋白質）信息、疾病 - 目標關聯、藥物 - 疾病關係等。
• FDADrugLabelSearch：搜索FDA數據庫中的藥物標籤信息，包括藥物信息搜索、通用名和品牌名映射、不良反應查詢、藥物相互作用搜索等。
• get_drug_generic_name：在通用名和品牌名之間映射藥物名稱。
• MonarchSearch：搜索Monarch數據庫中的基因、疾病或表型。
• MonarchDiseasesForMultiplePhenotypes：找到與多個表型匹配的疾病。

📚 詳細文檔

實現的功能

該服務器包含JavaScript實現的以下功能：

1. executeOpenTargetQuery - 對OpenTarget API執行GraphQL查詢
2. FDADrugLabelSearch - 從FDA數據庫檢索藥物信息
3. get_drug_generic_name - 在通用名和品牌名之間映射藥物名稱
4. MonarchSearch - 搜索Monarch數據庫中的基因、疾病或表型
5. MonarchDiseasesForMultiplePhenotypes - 找到與多個表型匹配的疾病

OpenTarget功能

• 疾病信息查詢
• 藥物細節和關聯
• 目標（基因/蛋白質）信息
• 疾病 - 目標關聯
• 藥物 - 疾病關係

FDA藥物標籤功能

• 藥物信息搜索
• 通用名和品牌名映射
• 不良反應查詢
• 藥物相互作用搜索

Monarch數據庫功能

• 生物醫學實體搜索
• 疾病 - 表型關聯
• 基因 - 表型關係
• 多表型疾病查找

項目結構

medixhub-mcp-server/
├── server.js          # 主服務器文件
├── routes/           # API路由定義
│   ├── openTargetRoutes.js       # OpenTarget相關路由
│   └── monarchRoutes.js         # Monarch相關路由
├── controllers/      # 控制器邏輯
│   ├── openTargetController.js  # OpenTarget控制器
│   └── monarchController.js     # Monarch控制器
└── .env.example       # 環境變量示例文件

性能考慮

• ⏱️ 所有API調用都使用異步處理，提高響應速度。
• 🚫 啟用了速率限制以防止濫用，保障系統穩定性。
• ⏰ 超時處理可防止請求掛起，避免資源浪費。
• 💾 內存使用經過優化，以高效處理流，提升系統性能。

📄 許可證

該項目根據MIT許可證發佈 - 有關詳細信息，請參閱LICENSE文件。