Uniprot MCP Server

🚀 UniProt MCP 服務器

UniProt MCP 服務器是一個基於 MCP（模型上下文協議）的服務器，它能讓語言模型從 UniProt 數據庫中獲取蛋白質信息。該服務器可與 Claude Desktop 及其他兼容的 AI 應用程序集成，為用戶提供便捷的蛋白質信息查詢服務。

🚀 快速開始

安裝

1. 克隆此倉庫：

   git clone https://github.com/yourusername/uniprot-mcp-server.git
   cd uniprot-mcp-server
   

2. 創建虛擬環境（可選但推薦）：

   python -m venv venv
   source venv/bin/activate  # 在 Windows 上：venv\Scripts\activate
   

3. 安裝依賴項：

   pip install -r requirements.txt
   

使用 Claude Desktop 的本地設置

1. 將服務器腳本設為可執行：

   chmod +x server.py
   

2. 配置 Claude Desktop 使用此 MCP 服務器：

   在 macOS/Linux 上：

   code ~/Library/Application\ Support/Claude/claude_desktop_config.json
   

   在 Windows 上：

   code $env:AppData\Claude\claude_desktop_config.json
   

3. 添加以下配置（更新路徑以匹配實際文件位置）：

   {
     "mcpServers": {
       "uniprot": {
         "command": "python",
         "args": [
           "/ABSOLUTE/PATH/TO/uniprot-mcp-server/server.py"
         ]
       }
     }
   }
   

4. 重啟 Claude Desktop

開發

要直接運行服務器進行測試：

python server.py

測試工具

此項目包含兩個測試工具以驗證功能：

1. 服務器健康檢查

驗證 MCP 服務器是否正常啟動且無錯誤：

python server_health_check.py

2. UniProt API 測試

測試與 UniProt API 的連通性，並驗證所有 API 調用按預期工作：

python test_server.py

在使用服務器之前運行這些測試，以確保一切配置正確。

✨ 主要特性

• 搜索 UniProt：可通過名稱、基因或其他標準搜索蛋白質。
• 獲取蛋白質詳細信息：能檢索有關蛋白質的詳細信息。
• 獲取蛋白質序列：可獲取氨基酸序列。
• 獲取蛋白質功能：能檢索功能註釋，包括 GO 術語。
• 獲取蛋白質結構：可查找相關的 PDB 結構。

💻 使用示例

設置完成後，您可以向 Claude 提問如下問題：

• “查找與阿爾茨海默病相關的蛋白質”
• “獲取蛋白 P05067（澱粉樣前體蛋白）的序列”
• “TP53 蛋白的功能是什麼？”
• “BRCA1 蛋白是否有已知的 3D 結構？”

📄 許可證

本項目採用 MIT 許可證。

🤝 貢獻

歡迎貢獻！請隨意提交 Pull Request！

1. 復刻倉庫。
2. 創建功能分支（git checkout -b feature/amazing-feature）。
3. 提交更改（git commit -m 'Add some amazing feature'）。
4. 推送到分支（git push origin feature/amazing-feature）。
5. 打開 Pull Request。