# 生物信息

PyMOL-MCP是一個通過Model Context Protocol (MCP)將PyMOL與Claude AI集成的工具，實現通過自然語言控制分子可視化和結構分析。

AlphaFold MCP服務器提供對AlphaFold蛋白質結構數據庫的全面訪問，包含結構檢索、置信度分析、批量處理和可視化準備等豐富工具。

該項目是基於Broad研究所Liftover工具的MCP服務接口，提供基因組座標轉換功能，支持單點、區間、變異和HGVS格式的轉換。

一個提供蛋白質數據庫(PDB)訪問的MCP服務器，支持結構搜索、信息獲取、文件下載和質量評估功能

為生物信息學家和計算生物學家提供的MCP服務器

SAMtools MCP為SAM/BAM/CRAM文件提供標準化操作接口，支持格式轉換、排序、統計等核心功能。

非官方的UniProt MCP服務器，提供26種生物信息學工具，支持蛋白質搜索、結構分析、功能註釋等高級功能，通過REST API直接訪問UniProt數據庫。

UniProt MCP服務器是一個為語言模型提供蛋白質信息查詢的服務，支持從UniProt數據庫搜索蛋白質、獲取詳細信息、序列、功能註釋和結構數據，可集成到Claude Desktop等AI應用中。

UniProt MCP服務器是一個提供蛋白質信息查詢的服務，支持通過UniProt編號獲取蛋白質功能和序列信息。

一個基於Model Context Protocol (MCP)的UniProt蛋白質信息查詢服務器，提供蛋白質功能、序列等信息的獲取服務，支持單條和批量查詢，具有緩存和錯誤處理功能。

AlphaFold MCP服務器是一個提供蛋白質結構預測分析工具的綜合平臺，支持結構檢索、質量評估、批量處理和可視化集成等功能。

該項目是一個提供GWAS Catalog REST API程序化接口的MCP服務器，支持訪問GWAS研究、變異、性狀和關聯數據，並自動處理大規模結果集。

非官方的STRING數據庫MCP服務器，提供蛋白質相互作用網絡分析、功能富集分析和比較基因組學工具，支持通過STRING API訪問全面的蛋白質數據。

一個實驗性的nf-core工具MCP項目，提供創建管道、模塊管理等功能

Bio-OS MCP Server是一個基於模型上下文協議的工具和提示服務器，為Bio-OS提供工作流管理和Docker鏡像構建功能，支持本地和雲端兩種部署方式。

非官方的STRING數據庫MCP服務器，提供蛋白質相互作用網絡分析、功能富集和比較基因組學工具，支持通過STRING API進行全面的蛋白質網絡研究。

Scanpy MCP是一個為單細胞RNA測序分析軟件Scanpy設計的自然語言處理服務器，支持通過自然語言進行數據讀寫、預處理、分析和可視化等操作，適用於研究人員和代理開發者。

OpenGenes-MCP是一個基於Model Context Protocol (MCP)的服務器，為OpenGenes數據庫提供標準化接口，用於訪問衰老和長壽研究數據。該服務器自動從Hugging Face Hub下載最新的OpenGenes數據庫，確保用戶始終能獲取最新數據。數據庫包含壽命變化實驗數據、基因分類標準、衰老標誌關聯和長壽關聯研究等內容，支持通過自然語言查詢轉換為SQL查詢，方便研究人員和AI助手使用。

非官方的基因本體MCP服務器，提供基因本體(GO)數據的全面訪問，支持AI系統進行基於本體的分析、基因註釋研究和功能富集研究。

UniProt MCP服務器是一個提供蛋白質信息查詢的服務，支持通過UniProt編號獲取蛋白質名稱、功能描述、序列等信息，並支持批量查詢和緩存功能。